96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0436 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 
471 aa  949    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  52.85 
 
 
446 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  52.71 
 
 
428 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  40.12 
 
 
452 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  38.77 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  42.27 
 
 
438 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000450762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3687  cell wall hydrolase/autolysin  38.85 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3791  cell wall hydrolase/autolysin  37.01 
 
 
450 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  30.69 
 
 
1805 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0488  putative lipoprotein  35.21 
 
 
201 aa  82.8  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  29.7 
 
 
591 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  32.14 
 
 
182 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0538  hypothetical protein  38.66 
 
 
204 aa  79  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0066  cell wall hydrolase/autolysin  27.2 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  27.47 
 
 
282 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.11 
 
 
907 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1705  hypothetical protein  35.38 
 
 
272 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0039  hypothetical protein  30.43 
 
 
201 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  31.62 
 
 
763 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0040  hypothetical protein  30.43 
 
 
203 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  31.9 
 
 
423 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  29.19 
 
 
323 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.9 
 
 
657 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  27.75 
 
 
481 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3179  hypothetical protein  32.81 
 
 
282 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.96 
 
 
478 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  36.84 
 
 
304 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  33.58 
 
 
483 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.33 
 
 
431 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  29.8 
 
 
291 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  32.23 
 
 
495 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  36.21 
 
 
890 aa  56.6  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
429 aa  57  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  25.3 
 
 
450 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  30.65 
 
 
514 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  30.89 
 
 
113 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  32.35 
 
 
529 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  28.37 
 
 
535 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.92 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  29.21 
 
 
383 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
541 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  27.4 
 
 
366 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  31.01 
 
 
263 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  30.23 
 
 
276 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  25.88 
 
 
259 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  27.27 
 
 
763 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
589 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  35.2 
 
 
175 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  25.12 
 
 
269 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  25.9 
 
 
332 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  26.23 
 
 
292 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  25.97 
 
 
269 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  26.51 
 
 
418 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  29.66 
 
 
732 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  31.55 
 
 
281 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  25.56 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  35.19 
 
 
251 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1867  hypothetical protein  30.29 
 
 
211 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.793284  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  25.41 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  24.12 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  24.58 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  30.77 
 
 
1176 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  28.8 
 
 
781 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  36.84 
 
 
620 aa  47.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  47.5 
 
 
1118 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  25.18 
 
 
320 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  30.7 
 
 
249 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  27.97 
 
 
845 aa  46.6  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  28.46 
 
 
426 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  26.19 
 
 
331 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  25 
 
 
451 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  28.83 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  29.85 
 
 
650 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  39.22 
 
 
754 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2738  hypothetical protein  30.35 
 
 
312 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.218964  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  25.97 
 
 
352 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  28.9 
 
 
625 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  25.62 
 
 
1305 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  31.4 
 
 
502 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 
206 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 
456 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  30.4 
 
 
758 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  26.51 
 
 
266 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  23.91 
 
 
421 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  30.17 
 
 
343 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  29.41 
 
 
948 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  27.83 
 
 
792 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  29.75 
 
 
340 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  39.29 
 
 
214 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 
547 aa  43.5  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 
298 aa  43.5  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  26.38 
 
 
262 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2310  hypothetical protein  32.93 
 
 
242 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  26.03 
 
 
474 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2689  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>