More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0387 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
309 aa  600  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  72.14 
 
 
284 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0349  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  61.54 
 
 
283 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0470  nickel ABC transporter, permease protein  51.89 
 
 
290 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.39 
 
 
287 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 
330 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.540099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.01 
 
 
373 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7616  nickel transporter permease NikC  52.94 
 
 
291 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  51.13 
 
 
300 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.21 
 
 
309 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  47.19 
 
 
299 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  47.19 
 
 
299 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  47.19 
 
 
299 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  47.19 
 
 
299 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  47.19 
 
 
299 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
295 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.62 
 
 
298 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.44 
 
 
293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0802  nickel transporter permease NikC  50.19 
 
 
290 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0752  nickel transporter permease NikC  50.56 
 
 
290 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  47.96 
 
 
279 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
287 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0022  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  47.62 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.38 
 
 
292 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
304 aa  251  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.2 
 
 
300 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  49.39 
 
 
282 aa  250  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.52 
 
 
305 aa  249  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
299 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.39 
 
 
299 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  49.8 
 
 
270 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  46.97 
 
 
288 aa  246  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  48.38 
 
 
301 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
307 aa  245  9e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273251  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 
300 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
303 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.97 
 
 
294 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.89 
 
 
469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000142566  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.02 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.52 
 
 
289 aa  238  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  45.96 
 
 
288 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  46.42 
 
 
301 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 
280 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.5 
 
 
304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  46.77 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.02 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  43.4 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  46.96 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.32 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.28 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.41 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.4 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  48.3 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.57 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.3 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.33 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.69 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 
277 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  43.02 
 
 
283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  43.4 
 
 
283 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
283 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  47.41 
 
 
300 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1977  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.88 
 
 
292 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
312 aa  231  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.02 
 
 
283 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
270 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3007  nickel transporter permease NikC  50.83 
 
 
281 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.524853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.85 
 
 
305 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58779  normal  0.456296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  42.96 
 
 
293 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2275  nickel transporter permease NikC  49 
 
 
299 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0126063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
283 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 
301 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
299 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 
310 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
356 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
307 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3843  nickel transporter permease NikC  45.75 
 
 
277 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.34 
 
 
304 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 
297 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
304 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.043674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
304 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
304 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
304 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0666762  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
495 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 
297 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.26 
 
 
301 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 
307 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
299 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 
300 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3677  nickel transporter permease NikC  45.34 
 
 
277 aa  228  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  46.3 
 
 
300 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1251  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  47.2 
 
 
304 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.92 
 
 
308 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.49 
 
 
298 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>