70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0349 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 106 aa  205  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  53.68 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  51.61 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  51.65 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  54.26 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  39.05 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  40.59 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  42.7 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  44.83 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  36.73 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  43.53 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  43.53 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  43.53 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  51.46 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  36.73 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  52.81 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  39.78 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  39.36 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  39.36 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  39.6 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  40.4 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  35.35 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  31.68 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  29.67 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  35.11 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  31.87 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  42.86 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  25.51 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  25.51 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  32.18 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  33.98 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  42.62 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0662  branched-chain amino acid transport  44.64 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00834286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  32.65 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  32.65 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  31.03 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  33.71 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  32.18 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  31.63 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  28.09 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  34.31 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  34.65 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  31.43 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  42.37 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  31.43 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0120  branched-chain amino acid transport  31.67 
 
 		 114 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000282674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  40.74 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  31.43 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 		 107 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  31.73 
 
 		 119 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>