More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0295 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 
614 aa  1225    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  55.81 
 
 
624 aa  679    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  52.88 
 
 
588 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  52.46 
 
 
622 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  50.25 
 
 
613 aa  568  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  45.62 
 
 
685 aa  551  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.11 
 
 
607 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 
615 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  41.94 
 
 
625 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  43.27 
 
 
641 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 
628 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  42.3 
 
 
607 aa  497  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  40.45 
 
 
620 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  40.29 
 
 
620 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  45.47 
 
 
653 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  43.59 
 
 
613 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  42.13 
 
 
607 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  41.64 
 
 
607 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  39.65 
 
 
613 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  43.54 
 
 
669 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  39.57 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  41.87 
 
 
601 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  43.83 
 
 
665 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 
604 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  44.78 
 
 
610 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 
638 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  43.24 
 
 
617 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  43.58 
 
 
590 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  40.76 
 
 
656 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  40.87 
 
 
614 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  42.03 
 
 
626 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  41.72 
 
 
612 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  43 
 
 
611 aa  435  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  41.05 
 
 
677 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  42.04 
 
 
613 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.86 
 
 
619 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 
666 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 
598 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 
604 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  41.37 
 
 
591 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  41.19 
 
 
675 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  40.25 
 
 
636 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  40.22 
 
 
671 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 
594 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 
594 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 
594 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  41.88 
 
 
647 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 
624 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  41.52 
 
 
623 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  36.9 
 
 
616 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 
594 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 
628 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 
594 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 
594 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 
594 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 
593 aa  422  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  41.55 
 
 
649 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  44.44 
 
 
615 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 
594 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  41.2 
 
 
649 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  42.52 
 
 
594 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 
594 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 
627 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 
617 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 
594 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 
627 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 
622 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 
617 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 
596 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 
631 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  39 
 
 
625 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  41.65 
 
 
649 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.32 
 
 
613 aa  415  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  40.55 
 
 
613 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  40.76 
 
 
658 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 
591 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  41.57 
 
 
609 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  41.48 
 
 
689 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 
594 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 
652 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 
640 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
652 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  41.52 
 
 
643 aa  412  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 
640 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  40.77 
 
 
641 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  39.69 
 
 
693 aa  409  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 
652 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 
593 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 
593 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  41.21 
 
 
670 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
646 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  42.29 
 
 
644 aa  405  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  39.48 
 
 
679 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.28 
 
 
644 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 
610 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.33 
 
 
708 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  40.54 
 
 
636 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  36.48 
 
 
658 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  40.35 
 
 
678 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 
616 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>