235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0281 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  100 
 
 
498 aa  1026  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  4.57965e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  60.64 
 
 
499 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  58.75 
 
 
499 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  59.56 
 
 
499 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  56.94 
 
 
500 aa  605  1e-172  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  58.13 
 
 
507 aa  602  1e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  58.03 
 
 
500 aa  571  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  49.09 
 
 
493 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.23828e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  47.31 
 
 
499 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.29411e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  47.99 
 
 
496 aa  467  1e-130  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  46.69 
 
 
496 aa  454  1e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  47.8 
 
 
494 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  45.45 
 
 
497 aa  448  1e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  47.69 
 
 
494 aa  445  1e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  42.8 
 
 
495 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  6.88351e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  47.28 
 
 
522 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  44.89 
 
 
502 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  2.59641e-08 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  44.18 
 
 
485 aa  407  1e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  43.49 
 
 
508 aa  408  1e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  45.44 
 
 
496 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  46.22 
 
 
516 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  48.37 
 
 
490 aa  400  1e-110  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  2.94032e-07 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  43.06 
 
 
487 aa  394  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  43.25 
 
 
504 aa  360  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  41.46 
 
 
473 aa  322  1e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  37.08 
 
 
490 aa  316  8e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  42.33 
 
 
476 aa  315  1e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  41.84 
 
 
472 aa  315  2e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  41.38 
 
 
472 aa  314  3e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  39.79 
 
 
469 aa  313  5e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  39.79 
 
 
469 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  39.79 
 
 
469 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  39.03 
 
 
469 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  40.54 
 
 
469 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  39.79 
 
 
469 aa  310  3e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  39.03 
 
 
469 aa  310  3e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  40.92 
 
 
472 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  39.03 
 
 
469 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  40.68 
 
 
469 aa  308  1e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  40.73 
 
 
465 aa  308  1e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  40.94 
 
 
471 aa  307  2e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  42.56 
 
 
470 aa  308  2e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  40.92 
 
 
472 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  41.72 
 
 
461 aa  306  4e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  9.88233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  41.38 
 
 
472 aa  306  5e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  40.09 
 
 
471 aa  306  8e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  41.61 
 
 
471 aa  305  9e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  39.86 
 
 
469 aa  305  9e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  41.42 
 
 
471 aa  305  9e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  41.78 
 
 
471 aa  304  2e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  40.46 
 
 
461 aa  304  2e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.11335e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  41.27 
 
 
468 aa  304  3e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  40.68 
 
 
469 aa  303  3e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  39.33 
 
 
470 aa  303  5e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  39.82 
 
 
470 aa  302  8e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  39.82 
 
 
470 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  36.24 
 
 
491 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  40.82 
 
 
463 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  40.82 
 
 
463 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  40.67 
 
 
474 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  40.99 
 
 
470 aa  299  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  39.36 
 
 
463 aa  298  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  35.39 
 
 
498 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  40.91 
 
 
458 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  41.14 
 
 
461 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  40.5 
 
 
462 aa  297  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  38.67 
 
 
463 aa  297  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  40.09 
 
 
470 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  40.73 
 
 
461 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  40.96 
 
 
461 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  41.14 
 
 
458 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  6.09388e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  38.32 
 
 
460 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  2.45714e-08 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  40.18 
 
 
467 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  39.82 
 
 
465 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  37.65 
 
 
465 aa  292  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  40.05 
 
 
461 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  33.68 
 
 
580 aa  290  5e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  41.04 
 
 
460 aa  290  5e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.35451e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  35.63 
 
 
476 aa  290  6e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  33.06 
 
 
487 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  39.09 
 
 
461 aa  289  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  36.61 
 
 
547 aa  288  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  39.78 
 
 
453 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  39.32 
 
 
463 aa  285  1e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  36.67 
 
 
511 aa  284  3e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  34.29 
 
 
487 aa  283  4e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  39.36 
 
 
435 aa  283  7e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  41.14 
 
 
459 aa  282  8e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  39.6 
 
 
476 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  39.6 
 
 
476 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  36.48 
 
 
465 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  38.6 
 
 
466 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  38.27 
 
 
460 aa  279  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  37.67 
 
 
504 aa  276  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  39.64 
 
 
465 aa  275  1e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  37.34 
 
 
472 aa  275  1e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  36.84 
 
 
462 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  40.14 
 
 
467 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  38.2 
 
 
477 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  38.5 
 
 
481 aa  267  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>