More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0272 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0272  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
536 aa  1057  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00870047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  35.47 
 
 
513 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  36.7 
 
 
516 aa  315  2e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  36.63 
 
 
516 aa  313  6e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  36.51 
 
 
516 aa  313  7e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  36.45 
 
 
516 aa  313  7e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  36.51 
 
 
516 aa  312  8e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  36.51 
 
 
516 aa  312  8e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  36.51 
 
 
516 aa  312  8e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  36.26 
 
 
516 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  36.33 
 
 
516 aa  310  3e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.08 
 
 
516 aa  310  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.35 
 
 
516 aa  302  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  36.21 
 
 
511 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.17 
 
 
524 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  35.13 
 
 
559 aa  264  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.96 
 
 
516 aa  263  7e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.46 
 
 
515 aa  263  7e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  34.54 
 
 
515 aa  263  7e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  36.72 
 
 
666 aa  263  7e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  35.47 
 
 
519 aa  262  9e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  36.16 
 
 
513 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  33.27 
 
 
577 aa  260  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.02 
 
 
659 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40042e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  35.88 
 
 
564 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  34.54 
 
 
549 aa  257  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  34.54 
 
 
549 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  35.22 
 
 
549 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  34.54 
 
 
549 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  34.54 
 
 
549 aa  256  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  36.5 
 
 
665 aa  255  1e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  35.22 
 
 
549 aa  255  1e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  34.34 
 
 
549 aa  255  2e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  35 
 
 
549 aa  254  2e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  34.34 
 
 
549 aa  255  2e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  35.43 
 
 
549 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  35.88 
 
 
571 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  35.43 
 
 
549 aa  254  4e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  35.43 
 
 
549 aa  254  4e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  35.43 
 
 
549 aa  254  4e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  35.43 
 
 
549 aa  254  4e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.64 
 
 
539 aa  253  8e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  35.17 
 
 
574 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.46 
 
 
561 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  34.46 
 
 
561 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  35.86 
 
 
561 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  35.86 
 
 
561 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  35.86 
 
 
561 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  34.01 
 
 
553 aa  249  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.39 
 
 
560 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  36.14 
 
 
661 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  34.25 
 
 
563 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  34.72 
 
 
584 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  35.49 
 
 
561 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  35.12 
 
 
550 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  35.6 
 
 
563 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  34.23 
 
 
572 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  35.6 
 
 
563 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.58 
 
 
575 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  35.69 
 
 
561 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25230  acetate permease  35.74 
 
 
554 aa  246  5e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  36.2 
 
 
544 aa  246  1e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  33.93 
 
 
552 aa  245  2e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  35.38 
 
 
584 aa  245  2e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  33.12 
 
 
552 aa  245  2e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  35.5 
 
 
584 aa  244  2e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  33.52 
 
 
541 aa  244  2e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  33.12 
 
 
552 aa  245  2e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  35.71 
 
 
552 aa  245  2e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.41 
 
 
552 aa  244  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  34.8 
 
 
577 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  31.79 
 
 
554 aa  244  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  33.83 
 
 
561 aa  244  4e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.33 
 
 
541 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  33.93 
 
 
552 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  34.72 
 
 
576 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  35.18 
 
 
549 aa  243  8e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.76 
 
 
563 aa  243  8e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0429  acetate permease  35.67 
 
 
561 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.839337  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36 
 
 
554 aa  243  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.27 
 
 
530 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  33.33 
 
 
554 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  34.31 
 
 
553 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.14 
 
 
570 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  34.3 
 
 
554 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  34.9 
 
 
574 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  32.9 
 
 
551 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  33.15 
 
 
541 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  33.9 
 
 
557 aa  241  3e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  32.71 
 
 
551 aa  241  3e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  3.16225e-14 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  34.1 
 
 
554 aa  241  3e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  34.13 
 
 
576 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  34.13 
 
 
576 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  34.69 
 
 
552 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  34.1 
 
 
554 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.02 
 
 
563 aa  240  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  33.62 
 
 
552 aa  240  6e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  36.19 
 
 
554 aa  239  6e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  31.52 
 
 
548 aa  240  6e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  33.9 
 
 
551 aa  239  7e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>