More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0245 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 424 aa  842    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  74.4 
 
 		 419 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  77.38 
 
 		 421 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  75.84 
 
 		 419 aa  636    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  65.71 
 
 		 420 aa  561  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  62 
 
 		 421 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  57.07 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  59.02 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.81 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  53 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  54.78 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  52.49 
 
 		 435 aa  448  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  50.7 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  48.17 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  52.74 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  51.05 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  52.91 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  50.82 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  51.42 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  48.83 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  47.81 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  50.82 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  47.67 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  48.6 
 
 		 443 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  48.6 
 
 		 443 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  49.3 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  47.9 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  50 
 
 		 422 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  47.07 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  49.11 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  47.24 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  49.77 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  47.16 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  48.33 
 
 		 437 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  47.07 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  49.52 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  47.62 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  48.24 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  48.69 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  48.33 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  49.29 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  46 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  47.37 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  46.41 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  47.37 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  47.13 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  48.1 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  46.41 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  48.11 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  49.05 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  49.06 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  47.72 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  46.41 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  49.64 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  49.52 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  45.2 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  49.52 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  46.65 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  46.41 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  46.65 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.85 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  48.85 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  48.85 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  48.85 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  48.98 
 
 		 436 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  49.52 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  47.36 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.85 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  48.85 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  46.26 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  46.65 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  48.62 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  48.62 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  45.67 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  49.1 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  49.64 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  49.64 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  49.64 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  48.62 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  46.98 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  48.38 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>