282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0243 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  100 
 
 		 51 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  67.35 
 
 		 62 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  65.31 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  59.18 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  56 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 61 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  48 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  54 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  52.94 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  52.94 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  54 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  54.9 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  52 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  54 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  59.52 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  58 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  55.1 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  50.98 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  54.17 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  54.17 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  54 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  60 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  48 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  56 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  54.17 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  48 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  47.92 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  51.02 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  55.1 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  46.94 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  48 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0451  50S ribosomal protein L30  42 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  54.17 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 58 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>