More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0225 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  69.71 
 
 		 209 aa  298  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  69.08 
 
 		 209 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  69.57 
 
 		 209 aa  294  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  64.9 
 
 		 209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  58.57 
 
 		 212 aa  268  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  61.35 
 
 		 209 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  60.1 
 
 		 210 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  61.35 
 
 		 211 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  60 
 
 		 211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  59.9 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  59.9 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  58.1 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  59.7 
 
 		 213 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  58.65 
 
 		 210 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 211 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 208 aa  234  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 208 aa  232  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  56.52 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  56.37 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  56.37 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 213 aa  228  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 210 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  49.54 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  54.46 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  53.2 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 212 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 219 aa  217  8.999999999999998e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 218 aa  217  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.42 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  51.13 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  49.54 
 
 		 220 aa  214  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 207 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 		 212 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  53.05 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  49.53 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  48.61 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 215 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  48.11 
 
 		 218 aa  207  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  53.85 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 216 aa  207  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 219 aa  207  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  52.34 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  52.11 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  51.21 
 
 		 247 aa  205  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  52.11 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  52.11 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 217 aa  204  6e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  51.46 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  48.22 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  49.51 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>