More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0210 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  100 
 
 		 178 aa  356  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  69.14 
 
 		 175 aa  257  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  66.67 
 
 		 175 aa  248  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  63.28 
 
 		 175 aa  240  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  67.98 
 
 		 175 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  70.06 
 
 		 175 aa  235  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  59.89 
 
 		 174 aa  228  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  58.76 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  55.37 
 
 		 181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  53.71 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  56.82 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  56.82 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  57.39 
 
 		 182 aa  209  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  59.55 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  59.32 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  58.86 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  52.84 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  49.14 
 
 		 194 aa  204  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  52.27 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  51.72 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  52.84 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  49.14 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  60.45 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  58.05 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  52.3 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  56.9 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  59.89 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  52.51 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  52.84 
 
 		 174 aa  188  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  50 
 
 		 202 aa  185  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  48 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  48 
 
 		 196 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  49.44 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  51.45 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  50.56 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  47.73 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  47.16 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  49.17 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2259  NusG antitermination factor  47.73 
 
 		 212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  48.6 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  47.49 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  46.37 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  46.91 
 
 		 198 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  47.73 
 
 		 203 aa  178  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 		 193 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  46.59 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  46.93 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  46.77 
 
 		 306 aa  178  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 		 193 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  47.75 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  48.31 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  47.75 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  47.16 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  47.75 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  47.75 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  47.49 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  47.19 
 
 		 175 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  47.49 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  45.41 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  45.81 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  45.81 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  45.11 
 
 		 273 aa  174  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  50.56 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  47.19 
 
 		 175 aa  174  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  46.63 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  45.45 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>