More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0207 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  79.4 
 
 		 397 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  99.75 
 
 		 400 aa  816    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  84.17 
 
 		 400 aa  694    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  83.67 
 
 		 400 aa  697    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  80.9 
 
 		 400 aa  650    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  83.71 
 
 		 400 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  100 
 
 		 399 aa  818    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  79.65 
 
 		 400 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  83.67 
 
 		 400 aa  692    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  83.71 
 
 		 400 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  82.66 
 
 		 400 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  80.65 
 
 		 400 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  79.4 
 
 		 397 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  78.14 
 
 		 395 aa  638    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  80.9 
 
 		 400 aa  650    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  82.96 
 
 		 400 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  82.96 
 
 		 400 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  83.67 
 
 		 400 aa  697    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  80.7 
 
 		 400 aa  680    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  80.7 
 
 		 400 aa  679    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  77.14 
 
 		 400 aa  632  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  76.38 
 
 		 400 aa  628  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  76.38 
 
 		 400 aa  628  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 405 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 405 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  76.13 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  76.13 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  76.13 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  76.92 
 
 		 402 aa  614  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  77.14 
 
 		 399 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  74.87 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 399 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  77.19 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  74.87 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  75.93 
 
 		 402 aa  607  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  74.87 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  74.87 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  73.93 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 400 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  76.98 
 
 		 405 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 394 aa  606  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>