More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0182 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 445 aa  877    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  54.12 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  60.92 
 
 		 449 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  53.9 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  54.12 
 
 		 458 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  57.89 
 
 		 457 aa  484  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  53.45 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  54.26 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  55 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  54.63 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  54.05 
 
 		 489 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 448 aa  468  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  51.35 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  55.2 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  56.46 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  55.03 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  55.51 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  49.21 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  51.12 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  55.36 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  52.69 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  55.88 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  50.56 
 
 		 454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  53.35 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  50.9 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  54.55 
 
 		 453 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  52.66 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  51.01 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  54.93 
 
 		 443 aa  438  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  47.09 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  48.89 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  51.69 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  47.83 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  50.56 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  48.44 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  47.83 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  46.89 
 
 		 520 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  48.44 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  51.12 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  48.55 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 		 457 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  48.92 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  48.69 
 
 		 507 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  54.69 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  55.19 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  48.78 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  50.56 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  47.17 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  48.33 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  51.55 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  51.77 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  49.16 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  47.83 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  51.7 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  51.08 
 
 		 476 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1803  DNA repair protein RadA  52.83 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  54.69 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  51.69 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  51.7 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2252  DNA repair protein RadA  50.65 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  51.38 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  45.98 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  46.86 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  46.38 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  51.9 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  52.47 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  51.33 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  50.67 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  52.15 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  51.56 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  51.33 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  45.01 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  51.9 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  52.44 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  50.67 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  51.9 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  50.89 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  50.6 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  47.74 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>