224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0171 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 420 aa  855    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  60.39 
 
 		 416 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  58.85 
 
 		 420 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  60.44 
 
 		 422 aa  527  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  61.29 
 
 		 416 aa  523  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.17 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.6 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.48 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  53.75 
 
 		 473 aa  471  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  54 
 
 		 473 aa  471  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  54.24 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  53.75 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  53.75 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  53.75 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  53.75 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  53.75 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  53.75 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.75 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  55.96 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.17 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.3 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  54.31 
 
 		 708 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  54.07 
 
 		 730 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  54.46 
 
 		 730 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.17 
 
 		 433 aa  448  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.35 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.45 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  54.52 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  52.21 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.26 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.88 
 
 		 437 aa  441  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  53.86 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  56.2 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.96 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.3 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.77 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  53.04 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.27 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.5 
 
 		 437 aa  428  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.54 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.22 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  52.55 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.22 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.06 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  56.94 
 
 		 375 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  50.61 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.53 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.39 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.47 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.91 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  51.1 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  51.1 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  50.55 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  49.34 
 
 		 527 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  49.18 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.47 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  47.89 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.23 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.43 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.3 
 
 		 413 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  49.86 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.25 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.46 
 
 		 408 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.73 
 
 		 422 aa  358  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.71 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.53 
 
 		 385 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.14 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  51.99 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.86 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.86 
 
 		 344 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.66 
 
 		 374 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.09 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.15 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.4 
 
 		 346 aa  330  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  47.27 
 
 		 402 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.54 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.45 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  51.27 
 
 		 344 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  51.72 
 
 		 353 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.05 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.32 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.76 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  49.35 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.12 
 
 		 356 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.58 
 
 		 350 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.18 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  48.45 
 
 		 366 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.42 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  42.98 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  42.02 
 
 		 393 aa  260  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  40.87 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  45.92 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  45.08 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.65 
 
 		 347 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.57 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.58 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.94 
 
 		 363 aa  253  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
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NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.07 
 
 		 353 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.73 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  41.89 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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