More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0088 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 
150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  71.14 
 
 
149 aa  225  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  67.79 
 
 
149 aa  224  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  66.44 
 
 
149 aa  209  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 
149 aa  197  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  57.82 
 
 
149 aa  196  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  57.72 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  60.4 
 
 
149 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  60.93 
 
 
155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  60 
 
 
151 aa  191  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  59.44 
 
 
143 aa  191  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  61.33 
 
 
160 aa  191  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  61.64 
 
 
152 aa  189  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  54.67 
 
 
150 aa  189  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  56.08 
 
 
166 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  55.7 
 
 
149 aa  186  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  56.76 
 
 
148 aa  186  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  56.76 
 
 
148 aa  186  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  56.76 
 
 
148 aa  186  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  56.76 
 
 
148 aa  186  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  56.76 
 
 
148 aa  186  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  56.76 
 
 
148 aa  186  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  56.08 
 
 
148 aa  186  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  56.08 
 
 
148 aa  186  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  55.7 
 
 
149 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  56.08 
 
 
148 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  53.02 
 
 
149 aa  184  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  56.08 
 
 
148 aa  184  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  55.7 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  55.03 
 
 
149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  52.35 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  55.03 
 
 
149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  53.02 
 
 
149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  58.04 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  55.7 
 
 
149 aa  180  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  60.58 
 
 
138 aa  178  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0718  nucleoside diphosphate kinase  57.72 
 
 
149 aa  178  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0214366  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  53.02 
 
 
149 aa  178  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  55.03 
 
 
149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  56.67 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  55.7 
 
 
153 aa  176  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  55.24 
 
 
143 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  53.69 
 
 
149 aa  175  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  53.79 
 
 
148 aa  175  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  52.35 
 
 
149 aa  174  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  55.41 
 
 
150 aa  174  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  54.73 
 
 
152 aa  174  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  56.72 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  55.7 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  50.34 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  59.85 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  51.35 
 
 
152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  54.36 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  54.67 
 
 
154 aa  170  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  54.61 
 
 
142 aa  171  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  55.63 
 
 
151 aa  170  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  54.73 
 
 
151 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0687  nucleoside diphosphate kinase  55.03 
 
 
150 aa  169  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.36763 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  54.05 
 
 
151 aa  168  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  53.19 
 
 
142 aa  167  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
149 aa  167  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  53.19 
 
 
142 aa  166  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  51.01 
 
 
151 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  51.01 
 
 
151 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
151 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  53.02 
 
 
152 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  54 
 
 
154 aa  165  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  56.92 
 
 
139 aa  164  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  52.03 
 
 
152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  57.89 
 
 
135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  53.02 
 
 
152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  48.65 
 
 
217 aa  163  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  53.02 
 
 
152 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  51.72 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  58.02 
 
 
137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  56.06 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  56.92 
 
 
137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  53.69 
 
 
152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  51.8 
 
 
147 aa  160  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  56.82 
 
 
136 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  57.14 
 
 
134 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0526  nucleoside diphosphate kinase  48.99 
 
 
149 aa  158  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 
140 aa  158  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26635  predicted protein  50.69 
 
 
144 aa  157  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 
141 aa  157  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  55.3 
 
 
136 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  54.2 
 
 
135 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  58.91 
 
 
140 aa  153  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 
131 aa  152  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 
136 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2228  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 
135 aa  150  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0390683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  53.49 
 
 
134 aa  150  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  52.31 
 
 
134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  47.26 
 
 
154 aa  150  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0038  nucleoside-diphosphate kinase  48.2 
 
 
147 aa  150  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  55.73 
 
 
136 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  47.1 
 
 
148 aa  147  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1295  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 
140 aa  147  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>