More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0083 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  77.51 
 
 		 289 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  72.22 
 
 		 290 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  64.36 
 
 		 310 aa  384  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  60.49 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  60.49 
 
 		 292 aa  360  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  59.79 
 
 		 294 aa  359  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  59.79 
 
 		 294 aa  359  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  58.39 
 
 		 294 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 		 297 aa  345  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  58.8 
 
 		 286 aa  344  8e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  56.29 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  53.82 
 
 		 290 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 		 291 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 291 aa  330  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 		 291 aa  328  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 291 aa  324  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 291 aa  318  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  55.05 
 
 		 293 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  53.31 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  55.05 
 
 		 293 aa  309  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  55.05 
 
 		 294 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  46.21 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  46.18 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  45.17 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  42.36 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 285 aa  177  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  37.33 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  29.89 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  30.74 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  28.77 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  27.99 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>