16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0052 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  932    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  71.13 
 
 		 545 aa  685    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  32.97 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  28.87 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  29.4 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  23.9 
 
 		 522 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.84 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  21.91 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  21.36 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  21.53 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2271  hypothetical protein  35.96 
 
 		 173 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21430  hypothetical protein  20.27 
 
 		 418 aa  53.5  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2272  hypothetical protein  32.56 
 
 		 174 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  29.59 
 
 		 500 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  23.33 
 
 		 511 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  16.89 
 
 		 520 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>