More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0036 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  54.07 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  49.03 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  49.53 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  49.27 
 
 		 671 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  49.75 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.39 
 
 		 203 aa  178  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  51.08 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  49.1 
 
 		 703 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.23 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  49.76 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.75 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.01 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  51.61 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.04 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 686 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.04 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 705 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  50.8 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 901 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  41.58 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  40.85 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  47.87 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 686 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  49.22 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  48.42 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  50.27 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.48 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  49.73 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  46.07 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 688 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  42.47 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  48.44 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.02 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  46.34 
 
 		 688 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.13 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 707 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  41.86 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  43.98 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  48.26 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.09 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  44.56 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  44.7 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  47.67 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40.44 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  47.67 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  50 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  40.21 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  43.16 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.1 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  37.79 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  42.58 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  42.59 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.86 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  44.1 
 
 		 295 aa  155  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  47.31 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.94 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  48.4 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.59 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  45 
 
 		 209 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  48.94 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  41.27 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  39.27 
 
 		 217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>