More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0031 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
447 aa  894  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  3.24435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  56.4 
 
 
540 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.15 
 
 
527 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33689e-06 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.13 
 
 
562 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.21 
 
 
561 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.44 
 
 
559 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.13 
 
 
562 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.13 
 
 
562 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.13 
 
 
562 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.88 
 
 
562 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.13 
 
 
562 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.57 
 
 
427 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.88 
 
 
562 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.88 
 
 
562 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.61 
 
 
562 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.88 
 
 
562 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.62 
 
 
562 aa  342  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.82 
 
 
589 aa  340  3e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.14 
 
 
602 aa  337  2e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.14 
 
 
554 aa  337  2e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.2733e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.65 
 
 
522 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.21 
 
 
550 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.59 
 
 
568 aa  333  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.26 
 
 
565 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.26 
 
 
565 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.24 
 
 
582 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.71 
 
 
611 aa  330  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
599 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.24 
 
 
579 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.5 
 
 
547 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.5 
 
 
547 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.78 
 
 
579 aa  328  1e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  46.63 
 
 
559 aa  325  7e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57 
 
 
567 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.88 
 
 
547 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  42.28 
 
 
499 aa  322  1e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  56.12 
 
 
586 aa  321  1e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  45.22 
 
 
562 aa  321  2e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.41 
 
 
551 aa  320  4e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.74 
 
 
589 aa  319  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.22 
 
 
570 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.19 
 
 
518 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  44.66 
 
 
548 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.08 
 
 
518 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.22 
 
 
582 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.82 
 
 
562 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.27385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.89 
 
 
569 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  46.5 
 
 
579 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.38 
 
 
588 aa  316  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.62 
 
 
632 aa  315  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  39.16 
 
 
602 aa  315  1e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.22 
 
 
649 aa  313  4e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.8 
 
 
613 aa  313  5e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.04981e-05  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.28 
 
 
644 aa  312  7e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.24 
 
 
606 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.31 
 
 
460 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.73 
 
 
601 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.06 
 
 
575 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.73 
 
 
601 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.39 
 
 
606 aa  303  6e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.35 
 
 
610 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.37 
 
 
939 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  8.37393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  40.14 
 
 
582 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.45747e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.95 
 
 
395 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.43 
 
 
478 aa  296  7e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.43 
 
 
478 aa  295  9e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  40.92 
 
 
396 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.2 
 
 
517 aa  293  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.44 
 
 
534 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.39 
 
 
550 aa  293  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.24 
 
 
467 aa  290  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.1 
 
 
1040 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.1 
 
 
1045 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.1 
 
 
1071 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.26 
 
 
570 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.31282e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.56 
 
 
554 aa  290  5e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  48.99 
 
 
572 aa  289  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  4.63974e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.73 
 
 
911 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  3.97841e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.1 
 
 
1002 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.58 
 
 
612 aa  287  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  41.67 
 
 
900 aa  286  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.98 
 
 
647 aa  286  4e-76  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.81 
 
 
695 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.92 
 
 
795 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.82 
 
 
690 aa  286  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.65 
 
 
793 aa  285  1e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  43.77 
 
 
807 aa  284  2e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.51 
 
 
682 aa  284  2e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50 
 
 
730 aa  284  3e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1446  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.84 
 
 
821 aa  284  3e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223161  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.68 
 
 
921 aa  284  3e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.91992e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.73 
 
 
1115 aa  283  4e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1827  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.18 
 
 
787 aa  283  5e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6252  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.18 
 
 
787 aa  283  5e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1765  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.51 
 
 
824 aa  283  5e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.49 
 
 
634 aa  283  6e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.55 
 
 
690 aa  282  7e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.18 
 
 
793 aa  282  7e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.67 
 
 
813 aa  282  7e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.45 
 
 
1147 aa  282  7e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  5.34901e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>