156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_R0031 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_R0006  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0737139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0022  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143426  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.215273  unclonable  0.00000005091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0043  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.053179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0018  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 113 bp  75.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0049  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 113 bp  75.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0059  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 113 bp  75.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0074  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 113 bp  75.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0082  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 113 bp  75.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0085  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 113 bp  75.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0055  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 113 bp  71.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00493  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0275686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05582  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00903863  normal  0.193951 
 
 
-
 
NC_003295  RS05739  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0893083  normal  0.824943 
 
 
-
 
NC_003296  RS05424  ribosomal RNA-5S  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0043  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 112 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0044  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0070  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.319985  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0065  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 112 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509786  normal  0.0321697 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0066  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.0321697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0020  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.420174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0055  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0051  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0006  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0054  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 112 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0041  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.742431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0060  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.534885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0015  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.968472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0065  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0050  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0060  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0074  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0079  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.810647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0053  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0016  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.966007  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0064  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0054  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_5s_rrfB  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165355  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm5SC  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0456447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0001  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0086  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0001  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000461312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1477  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3558  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1912  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0150114  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0088  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322083  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0009  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0019  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000864469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0029  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401927  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0071  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0005  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2043  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0131191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0083  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 112 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0076  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.885608  normal  0.494732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0023  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0267616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0013  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000286071  normal  0.223631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0029  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0070  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0080  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000339218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0005  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47652  normal  0.759465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0011  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.52779  normal  0.472403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0016  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000150605  normal  0.0430285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0004  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0036  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0051  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0062  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0224651  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0075  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0087  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0001  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 86 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0011  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000846557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0021  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0063  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 97 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0660998  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0080  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0083115  normal  0.01969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0086  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0207651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0001  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0010a  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00320739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0011  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 112 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000918889  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0063  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 112 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0021  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0005  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0988602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3105  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0639464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0011  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425687  normal  0.592263 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0089  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 112 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.826807 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0081  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.567884  normal  0.932493 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0007  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00293377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0925  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00633245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1991  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1332  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3539  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3768  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000330068  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0595  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.884038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1341  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3565  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35308  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3829  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0498  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0907  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.424601  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1894  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0186999  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3544  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0077  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552404  normal  0.045853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0075  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0262155  hitchhiker  0.00115285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>