More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4197 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  100 
 
 
444 aa  927    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  68.59 
 
 
444 aa  630  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  62.85 
 
 
455 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  61.21 
 
 
445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  62.62 
 
 
449 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  58.49 
 
 
439 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  58.49 
 
 
439 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  55.16 
 
 
449 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  54.93 
 
 
455 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  51.96 
 
 
444 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  42.14 
 
 
461 aa  358  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  35.59 
 
 
495 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  36.84 
 
 
507 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  37.42 
 
 
491 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  31.75 
 
 
441 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  32.86 
 
 
470 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  32.68 
 
 
417 aa  187  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  31.4 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  33.74 
 
 
480 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  31.2 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  30.69 
 
 
419 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  30.69 
 
 
419 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 
416 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  31.17 
 
 
587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  31.95 
 
 
406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  29.95 
 
 
422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
429 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  30.03 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  30.29 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  30.41 
 
 
429 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  30.41 
 
 
429 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  30.13 
 
 
429 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 
416 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  30.41 
 
 
429 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  29.8 
 
 
413 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  30.41 
 
 
429 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  33.93 
 
 
415 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  32.19 
 
 
424 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  30.08 
 
 
435 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  30.33 
 
 
436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  30.59 
 
 
435 aa  156  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  30.33 
 
 
435 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  29.66 
 
 
415 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  28.91 
 
 
415 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  32.52 
 
 
480 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  32.52 
 
 
480 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  32.52 
 
 
480 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  32.4 
 
 
414 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  30.63 
 
 
414 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  32.22 
 
 
480 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  28.93 
 
 
420 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  28.21 
 
 
417 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  31.01 
 
 
414 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  28.23 
 
 
506 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  29.92 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  30.1 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  33.23 
 
 
409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  29.43 
 
 
424 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  32.93 
 
 
405 aa  147  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  31.37 
 
 
415 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
410 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  27.52 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  32.21 
 
 
409 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  31.99 
 
 
584 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  28.54 
 
 
416 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
413 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  31.95 
 
 
647 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  31.53 
 
 
618 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 
563 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 
376 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.08 
 
 
384 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 
398 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
344 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
566 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 
566 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 
566 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
566 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
549 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 
413 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 
398 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.76 
 
 
425 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
476 aa  89.7  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  23.5 
 
 
566 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  23.5 
 
 
566 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  23.77 
 
 
573 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  24.14 
 
 
540 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
606 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  24.11 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  23.5 
 
 
566 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  23.77 
 
 
552 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  23.77 
 
 
552 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  23.77 
 
 
552 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 
378 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 
418 aa  86.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>