More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4193 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  78.57 
 
 
258 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  75.4 
 
 
268 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  75.71 
 
 
260 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  78.63 
 
 
270 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  74.9 
 
 
260 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  75.4 
 
 
268 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  72.95 
 
 
259 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  76.57 
 
 
260 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  69.84 
 
 
258 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  71.54 
 
 
262 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  70.97 
 
 
257 aa  358  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  70 
 
 
256 aa  345  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  70 
 
 
256 aa  344  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  68.91 
 
 
253 aa  341  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  68.91 
 
 
253 aa  341  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  64.92 
 
 
255 aa  337  9e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  68.35 
 
 
266 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  66.24 
 
 
257 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  42.08 
 
 
571 aa  192  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  42.32 
 
 
623 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  41.08 
 
 
568 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 
619 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  42.32 
 
 
619 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 
619 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 
629 aa  187  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  42.32 
 
 
558 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 
610 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 
610 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  39.5 
 
 
606 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
606 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
594 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 
572 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  38.91 
 
 
563 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  39 
 
 
585 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
563 aa  178  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.58 
 
 
244 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.49 
 
 
552 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  40.41 
 
 
568 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  40.41 
 
 
568 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 
244 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 
593 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  39.51 
 
 
575 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 
572 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 
573 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 
573 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
575 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 
567 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  40.59 
 
 
567 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  38.68 
 
 
250 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
567 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.02 
 
 
535 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.15 
 
 
536 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 
242 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
252 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
395 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  37.97 
 
 
389 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 
377 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
386 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
401 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  30.17 
 
 
400 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
246 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.87 
 
 
397 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
234 aa  95.9  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
399 aa  95.1  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
344 aa  89.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.44 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  29.44 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.43 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.19 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
450 aa  72  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.3 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  45.05 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.75 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.64 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
226 aa  63.9  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  23.43 
 
 
355 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.96 
 
 
809 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  29.07 
 
 
374 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.37 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  28.9 
 
 
377 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2467  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000260943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.42 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>