More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4163 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4163  radical SAM family protein  100 
 
 		 524 aa  1075    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0387  radical SAM domain-containing protein  63.98 
 
 		 552 aa  671    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  0.247194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  68.45 
 
 		 530 aa  723    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  68.07 
 
 		 530 aa  721    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  63.38 
 
 		 536 aa  683    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0866  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase family protein, putative  53.97 
 
 		 504 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  46.91 
 
 		 551 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  42.66 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1571  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.805269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  33.98 
 
 		 590 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  34.84 
 
 		 590 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  33.67 
 
 		 600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  33.87 
 
 		 569 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  33.86 
 
 		 656 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  32.81 
 
 		 581 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  32.02 
 
 		 583 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 575 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 		 557 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 583 aa  220  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  30.42 
 
 		 584 aa  219  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 559 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 535 aa  212  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  28.54 
 
 		 562 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 570 aa  193  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 622 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  28.03 
 
 		 624 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 623 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 616 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  26.96 
 
 		 609 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 589 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 625 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3180  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 646 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0095  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 625 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3713  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 669 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2412  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  23.95 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  21.6 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 634 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  20.28 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 630 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  26 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  19.83 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  25.11 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  29.19 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.62 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.65 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 369 aa  57  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3488  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 369 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 498 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 369 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  35.56 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0384  coproporphyrinogen III oxidase  32.29 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2413  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 529 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  22.02 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  21.89 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  33.77 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  23.85 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  23.84 
 
 		 524 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 503 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  20.89 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  21.93 
 
 		 501 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  30.52 
 
 		 529 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 424 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  27.21 
 
 		 409 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 525 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  28.67 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.84 
 
 		 470 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 681 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.85 
 
 		 522 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 533 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 471 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 527 aa  54.3  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 		 450 aa  53.9  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3339  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 479 aa  53.9  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.6 
 
 		 476 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0679  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 532 aa  53.9  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  25.11 
 
 		 522 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.65 
 
 		 472 aa  53.9  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  30.19 
 
 		 454 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>