More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4160 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  100 
 
 		 314 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  59.87 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  62.01 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  59.87 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  61.04 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  60.6 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  61.59 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  62.01 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  61.72 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  60.67 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  61.07 
 
 		 344 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  61.06 
 
 		 304 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  58.39 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  61.07 
 
 		 351 aa  361  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  61.07 
 
 		 351 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  61.07 
 
 		 306 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  61.07 
 
 		 304 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  61.07 
 
 		 304 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  61.07 
 
 		 304 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  61.07 
 
 		 304 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  59.6 
 
 		 304 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  60.26 
 
 		 320 aa  358  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  58.94 
 
 		 312 aa  358  8e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  59.93 
 
 		 304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  59.93 
 
 		 304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  57.05 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  60.07 
 
 		 373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  59.4 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  57.19 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  59.4 
 
 		 304 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  56.11 
 
 		 304 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  61.06 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  56.23 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  61.06 
 
 		 304 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  58.03 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  56.05 
 
 		 322 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  60.4 
 
 		 325 aa  338  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  55.45 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  55.81 
 
 		 304 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  50 
 
 		 315 aa  318  6e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  52.65 
 
 		 309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  51.85 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  51.85 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  53.62 
 
 		 310 aa  301  8.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  49.17 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  54.28 
 
 		 311 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  49.52 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  50 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  49.84 
 
 		 310 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  49.84 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  49.21 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  50.16 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  49.84 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  47.6 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  45.25 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.4 
 
 		 317 aa  261  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  45.72 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  46.82 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  43.89 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  46.05 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  42.19 
 
 		 323 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  44.12 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  45.9 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  44.48 
 
 		 293 aa  245  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  41.78 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  42.43 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.62 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.78 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.4 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.58 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  39.53 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 308 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  40.86 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.46 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  38.56 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  39.4 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.73 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.48 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  38.46 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  36.54 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.16 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.6 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.75 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.46 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>