168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4140 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  785    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  56.07 
 
 
391 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  51.28 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  51.29 
 
 
386 aa  381  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  52.05 
 
 
396 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  50.13 
 
 
393 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  50.51 
 
 
396 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  52.31 
 
 
396 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  52.31 
 
 
396 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  53.39 
 
 
384 aa  359  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  52.3 
 
 
410 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  52.3 
 
 
410 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  52.3 
 
 
396 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  52.3 
 
 
396 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  52.3 
 
 
396 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  52.3 
 
 
396 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  49.11 
 
 
396 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  51.25 
 
 
397 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  51.28 
 
 
410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  52.3 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  51.03 
 
 
396 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  47.86 
 
 
397 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  47.16 
 
 
417 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  49.36 
 
 
393 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  48.99 
 
 
396 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  47.16 
 
 
388 aa  345  7e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  51.28 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  49.23 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  47.61 
 
 
397 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  47.86 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  48.49 
 
 
400 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  46.33 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  47.86 
 
 
398 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  42.64 
 
 
394 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  44.29 
 
 
370 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  44.29 
 
 
370 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  44.13 
 
 
394 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  46.59 
 
 
358 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  44.71 
 
 
394 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  44.22 
 
 
404 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  43.47 
 
 
360 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  41.58 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  45.41 
 
 
366 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  41.75 
 
 
394 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  46.63 
 
 
376 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  43.73 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  37.8 
 
 
395 aa  266  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  38.1 
 
 
395 aa  266  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  44.8 
 
 
362 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  43.05 
 
 
394 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  40.53 
 
 
375 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  44.33 
 
 
369 aa  257  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  41.62 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  42.18 
 
 
337 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  42.97 
 
 
368 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  39.84 
 
 
375 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  40.11 
 
 
451 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  36.45 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  30.05 
 
 
384 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  35.73 
 
 
378 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  34.69 
 
 
385 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  35.68 
 
 
398 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  32.87 
 
 
387 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  32.89 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  35.96 
 
 
386 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  32.63 
 
 
385 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  33.98 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  34.33 
 
 
410 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  33.16 
 
 
385 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  34.58 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  31.22 
 
 
397 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  31.53 
 
 
377 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  31.25 
 
 
377 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.33 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  32.38 
 
 
387 aa  155  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  26.78 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  31.93 
 
 
394 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  28.12 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  29.88 
 
 
401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.93 
 
 
370 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  26.51 
 
 
370 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  27.97 
 
 
400 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  25.8 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  25.8 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  25.8 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  25.8 
 
 
368 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  30.46 
 
 
377 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  25.51 
 
 
370 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  24.78 
 
 
370 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  24.78 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  25.22 
 
 
368 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  27.78 
 
 
392 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  25.51 
 
 
370 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  31.12 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  33.15 
 
 
358 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  28.88 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  31.12 
 
 
405 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  27.71 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  27.04 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  30.63 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>