50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4124 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  43.81 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  42.39 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  44.32 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  43.27 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  39.58 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  42.11 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  42.31 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  38.18 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  41.51 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  40.74 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  33.98 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  39.81 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  37.78 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  38.89 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  42.39 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  32.35 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  38.53 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  38.53 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  41.67 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  34.07 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  34.74 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  40.57 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  40.57 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  40.57 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  30.59 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  30.59 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  30.59 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  37.04 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  36.19 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  32.99 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  28.17 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  38.33 
 
 		 95 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  29.41 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  29.25 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  30.85 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  29.25 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  34.62 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  26.09 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 		 107 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>