More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4121 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.74 
 
 
1340 aa  1778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  64.31 
 
 
1279 aa  1702    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  37.22 
 
 
1218 aa  744    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  70.09 
 
 
1308 aa  1868    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  65.99 
 
 
1345 aa  1759    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  62.24 
 
 
1307 aa  1622    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  57.36 
 
 
1277 aa  1454    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  67.4 
 
 
1342 aa  1793    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.37 
 
 
1289 aa  1535    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  64.94 
 
 
1308 aa  1681    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  100 
 
 
1291 aa  2669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  68.8 
 
 
1324 aa  1833    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  65.27 
 
 
1259 aa  1701    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  67.47 
 
 
1342 aa  1797    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  67.4 
 
 
1342 aa  1793    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  36.38 
 
 
1212 aa  738    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.13 
 
 
1286 aa  1423    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  36.89 
 
 
1202 aa  779    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.69 
 
 
1344 aa  1776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  66.54 
 
 
1341 aa  1776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  37.07 
 
 
1217 aa  749    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  37.69 
 
 
1214 aa  767    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.78 
 
 
1265 aa  1620    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.83 
 
 
1371 aa  1768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.69 
 
 
1341 aa  1778    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  66.1 
 
 
1364 aa  1791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  58.81 
 
 
1280 aa  1556    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  57.36 
 
 
1277 aa  1454    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  67.47 
 
 
1359 aa  1783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.46 
 
 
1279 aa  1708    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  66.67 
 
 
1345 aa  1765    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  36.92 
 
 
1213 aa  747    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.82 
 
 
1304 aa  1671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  67.4 
 
 
1342 aa  1793    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  63.48 
 
 
1307 aa  1649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  67.57 
 
 
1271 aa  1785    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  65.05 
 
 
1300 aa  1687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  64.8 
 
 
1292 aa  1680    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  66.62 
 
 
1349 aa  1801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 
1221 aa  772    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  67 
 
 
1324 aa  1791    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.39 
 
 
1307 aa  1626    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.41 
 
 
1292 aa  1603    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  66.69 
 
 
1341 aa  1778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.14 
 
 
1288 aa  1562    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  75.85 
 
 
1292 aa  2029    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.67 
 
 
1340 aa  1779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  66.82 
 
 
1345 aa  1769    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  67.32 
 
 
1342 aa  1794    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  36.46 
 
 
1212 aa  738    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.14 
 
 
1309 aa  1705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.69 
 
 
1341 aa  1778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  67.4 
 
 
1342 aa  1793    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.06 
 
 
1218 aa  775    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.2 
 
 
1282 aa  1372    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  67.47 
 
 
1342 aa  1797    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.65 
 
 
1304 aa  1687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  31.4 
 
 
1183 aa  519  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  32.27 
 
 
1188 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.8 
 
 
1187 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  30.78 
 
 
1197 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  30.57 
 
 
1183 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  32.33 
 
 
1204 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.47 
 
 
1227 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  37.23 
 
 
1210 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.81 
 
 
469 aa  106  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  23.7 
 
 
430 aa  105  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  25.22 
 
 
485 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.44 
 
 
434 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  25.12 
 
 
456 aa  102  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.42 
 
 
411 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.17 
 
 
459 aa  101  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  26.23 
 
 
480 aa  100  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.55 
 
 
413 aa  99.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.11 
 
 
429 aa  99.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.65 
 
 
459 aa  99.4  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.51 
 
 
456 aa  98.6  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.78 
 
 
413 aa  97.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  27.53 
 
 
489 aa  97.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  25.71 
 
 
457 aa  97.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.35 
 
 
460 aa  96.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.3 
 
 
493 aa  96.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  27.47 
 
 
490 aa  95.9  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1863  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.81 
 
 
430 aa  96.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.16 
 
 
460 aa  95.9  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.16 
 
 
460 aa  95.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.64 
 
 
494 aa  95.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.27 
 
 
474 aa  95.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  26.11 
 
 
431 aa  95.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.49 
 
 
482 aa  95.1  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  22.54 
 
 
423 aa  94.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.1 
 
 
475 aa  94.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  23.92 
 
 
461 aa  94.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  23.9 
 
 
730 aa  94.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  26.73 
 
 
501 aa  94.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.53 
 
 
481 aa  93.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.42 
 
 
495 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.58 
 
 
492 aa  93.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.42 
 
 
495 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  26.11 
 
 
497 aa  92.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>