203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4051 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-138  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 
252 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  44.16 
 
 
274 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  42.63 
 
 
261 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
252 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  42.46 
 
 
261 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  40.34 
 
 
252 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  40.25 
 
 
284 aa  168  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  39.48 
 
 
249 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  40.26 
 
 
249 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  41.52 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  41.63 
 
 
249 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  41.18 
 
 
234 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
249 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  41.18 
 
 
249 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  41.18 
 
 
249 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  41.18 
 
 
249 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  41.18 
 
 
249 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  41.18 
 
 
249 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  40.62 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  41.07 
 
 
249 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  40.62 
 
 
249 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  40.62 
 
 
249 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  40.62 
 
 
249 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  36.03 
 
 
304 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  39.73 
 
 
249 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  36.84 
 
 
265 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  36.03 
 
 
274 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.23403e-08  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  35.6 
 
 
260 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  36.33 
 
 
268 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 
253 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  34.9 
 
 
253 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  37.99 
 
 
265 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  37.29 
 
 
261 aa  135  6e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
261 aa  135  7e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
243 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
265 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  35.56 
 
 
243 aa  130  2e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  36.17 
 
 
259 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  35.17 
 
 
249 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  34.22 
 
 
285 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  33.05 
 
 
263 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
257 aa  117  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
270 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  33.33 
 
 
239 aa  108  7e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.93452e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  33.18 
 
 
274 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.28207e-08  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 
271 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  29.24 
 
 
263 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  31.42 
 
 
272 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  33.04 
 
 
271 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  34.65 
 
 
273 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
274 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  28.97 
 
 
265 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  31.22 
 
 
262 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  32.84 
 
 
271 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
251 aa  101  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  32.31 
 
 
268 aa  101  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  33 
 
 
272 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 
248 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  37.43 
 
 
276 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  31.8 
 
 
279 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  32.83 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  32.83 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 
268 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  31.42 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  30.32 
 
 
322 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  31.78 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  29.53 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  28.51 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  37.93 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  37.93 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  30.53 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.3069e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  40.91 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  31.02 
 
 
188 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  31.65 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.61839e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.73 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.57088e-08  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  31.9 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.99161e-08  hitchhiker  2.35132e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.36736e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  29.29 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.10917e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  34.02 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  34.02 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.80184e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  26.56 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.08782e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  29.44 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  6.16267e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  34.02 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  34.02 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  6.91126e-05  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  27.48 
 
 
305 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  27.48 
 
 
300 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  33.85 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.22433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  33.85 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.23566e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  33.85 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.29093e-08  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  33.85 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  33.85 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  6.12768e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  33.85 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.73622e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  33.85 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  29.44 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.29972e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  33.85 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.28041e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 
250 aa  85.1  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  33.85 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.35641e-09  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>