215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4005 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  100 
 
 		 329 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  72.76 
 
 		 347 aa  477  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  60.43 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  61.34 
 
 		 373 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  57.88 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  60.24 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  57.68 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  57.49 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  57.01 
 
 		 343 aa  374  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  57.23 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  59.12 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  57.43 
 
 		 351 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  60.84 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  57.19 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  59.74 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  56.63 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  54.41 
 
 		 330 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  56.39 
 
 		 331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  54.89 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  55.78 
 
 		 372 aa  348  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  54.46 
 
 		 330 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  57.4 
 
 		 341 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  56.9 
 
 		 328 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  53.67 
 
 		 333 aa  345  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  54.43 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  55.84 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  54.11 
 
 		 329 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  53.97 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  54.69 
 
 		 328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  53.04 
 
 		 326 aa  335  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  55.13 
 
 		 380 aa  335  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  52.05 
 
 		 363 aa  335  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  56.15 
 
 		 329 aa  334  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  53.46 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  53.16 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  54.02 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  51.88 
 
 		 339 aa  329  4e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  53.16 
 
 		 382 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  51.91 
 
 		 359 aa  328  9e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  53.82 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  52.65 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  50.92 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  53.05 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  53.46 
 
 		 329 aa  325  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  50.16 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  50.16 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  54.87 
 
 		 332 aa  322  6e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  53.82 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  50.16 
 
 		 325 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  50.47 
 
 		 343 aa  320  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  52.9 
 
 		 374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  53.97 
 
 		 345 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  49.85 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  50.79 
 
 		 343 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  53 
 
 		 351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  53.04 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  51.1 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  49.39 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  51.08 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  51.91 
 
 		 329 aa  308  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  52.08 
 
 		 364 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  47.98 
 
 		 331 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  47.66 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  47.66 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  47.66 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  47.66 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  47.66 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  51.27 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  47.66 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  54.67 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  47.35 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  50 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  47.04 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  49.37 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  49.36 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  46.25 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  45.02 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  50.79 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  47.63 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  46.08 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  49.06 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  44.06 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  45.86 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  50.31 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  48.68 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  47.5 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  49.21 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  48.62 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  50.31 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  50.31 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  50.84 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  44.72 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  40.82 
 
 		 312 aa  225  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  39.87 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  43.51 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  37.63 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  37.46 
 
 		 312 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  43.43 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  37.78 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  36.31 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>