More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3918 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  100 
 
 
433 aa  842  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  58.89 
 
 
430 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  54.33 
 
 
442 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  50.59 
 
 
434 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  53.23 
 
 
446 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  49.88 
 
 
429 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.12 
 
 
466 aa  342  6e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.44 
 
 
428 aa  341  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  49.65 
 
 
466 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  43.9 
 
 
432 aa  326  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  49.88 
 
 
437 aa  321  2e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  47.37 
 
 
471 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.61 
 
 
429 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  46.58 
 
 
425 aa  283  6e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  46.58 
 
 
418 aa  282  7e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.78 
 
 
430 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  41.9 
 
 
398 aa  280  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.77 
 
 
430 aa  273  4e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  45.95 
 
 
418 aa  272  8e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 
404 aa  223  5e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.15 
 
 
430 aa  221  2e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.79 
 
 
419 aa  221  2e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05818e-10 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 
402 aa  221  2e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  39.55 
 
 
407 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.26 
 
 
419 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  39.78 
 
 
412 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.36 
 
 
424 aa  215  2e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  39.42 
 
 
429 aa  214  3e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 
390 aa  210  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  37.37 
 
 
403 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.67095e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.01 
 
 
409 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.57 
 
 
416 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  39.67 
 
 
489 aa  201  2e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  9.75793e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 
444 aa  199  8e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.95 
 
 
419 aa  197  4e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  36.79 
 
 
394 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  34.83 
 
 
413 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.86 
 
 
395 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  3.59698e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
455 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 
405 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.96171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  33.63 
 
 
449 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.46 
 
 
465 aa  186  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  35.24 
 
 
493 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  32.94 
 
 
446 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 
416 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.24755e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  30 
 
 
405 aa  140  5e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  31.15 
 
 
416 aa  140  5e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  6.42362e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  31.15 
 
 
416 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.87508e-07  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.6 
 
 
409 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.85815e-06  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  30.87 
 
 
416 aa  137  3e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.21535e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.6 
 
 
410 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.9827e-08  hitchhiker  2.36896e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.56 
 
 
438 aa  134  4e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  28.54 
 
 
429 aa  128  2e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  31.74 
 
 
417 aa  128  2e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  26.18 
 
 
394 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  30.26 
 
 
414 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  31.97 
 
 
370 aa  126  8e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  31.97 
 
 
370 aa  126  8e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 
414 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  31.66 
 
 
370 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  29.45 
 
 
390 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.12 
 
 
398 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  32.72 
 
 
569 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.29 
 
 
478 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.93 
 
 
399 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 
409 aa  122  1e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 
384 aa  122  2e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  29.81 
 
 
408 aa  121  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  32.64 
 
 
397 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 
453 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  30.49 
 
 
393 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  29.5 
 
 
408 aa  120  5e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.81 
 
 
400 aa  120  5e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  25.8 
 
 
397 aa  120  5e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 
415 aa  119  8e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.23 
 
 
451 aa  119  8e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  29.25 
 
 
390 aa  118  2e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  29.84 
 
 
390 aa  117  4e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  32.98 
 
 
348 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.03 
 
 
392 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 
406 aa  116  7e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 
406 aa  116  7e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  29.71 
 
 
394 aa  116  7e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  31.19 
 
 
387 aa  116  1e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  28.27 
 
 
464 aa  115  1e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  9.06287e-10 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 
407 aa  115  1e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  30.16 
 
 
390 aa  116  1e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  28.71 
 
 
405 aa  115  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  26.99 
 
 
399 aa  116  1e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  32.78 
 
 
385 aa  115  1e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  29.04 
 
 
393 aa  115  2e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  27.16 
 
 
391 aa  115  2e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 
394 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.86 
 
 
401 aa  114  4e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  27.16 
 
 
391 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
445 aa  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  26.38 
 
 
402 aa  113  7e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.62 
 
 
471 aa  113  7e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 
410 aa  113  7e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 
397 aa  112  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>