More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3866 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 586 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 587 aa  1207    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 		 586 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 598 aa  716    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  72.11 
 
 		 587 aa  832    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 589 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 589 aa  606  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 592 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 587 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 586 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 592 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 588 aa  597  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 579 aa  595  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 579 aa  595  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 584 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 585 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 611 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 609 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 609 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 609 aa  550  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 556 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 559 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 554 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 561 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 563 aa  500  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 556 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 557 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 556 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 559 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 556 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 556 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 560 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 557 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 564 aa  475  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 559 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 564 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 594 aa  452  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 594 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 596 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 550 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 594 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 594 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 594 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 594 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 602 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 598 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 594 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 594 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 595 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 596 aa  439  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 577 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 567 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 594 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 561 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 551 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 569 aa  435  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 556 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 596 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 600 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 596 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 564 aa  429  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 565 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 593 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 575 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 561 aa  422  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 593 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 565 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>