186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3864 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  48.02 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.65 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  44.81 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  40.67 
 
 		 211 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  36.15 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  43.35 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  42.39 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  42.42 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  41.1 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  39.5 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  41.48 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  42.7 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  40.88 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 		 213 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.86 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  39.46 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  36.36 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  40.53 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.87 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.37 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  37.37 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 		 210 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.37 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.37 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.37 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  37.37 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.37 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.45 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  38.38 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  39.47 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.97 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  37.84 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  36.52 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  36.1 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  38.55 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  38.92 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  37.02 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  35.64 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  40.54 
 
 		 271 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  34.24 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.26 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  39.13 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.84 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  38.8 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.96 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  34.42 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  34.69 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  35.51 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  31.47 
 
 		 293 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  30.46 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  33.54 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  29.89 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  29.65 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.14 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.72 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.52 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  26.46 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  32.79 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  32.79 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  32.79 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.33 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.53 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.77 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>