More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3851 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  70.64 
 
 		 246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  71.31 
 
 		 243 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  70.21 
 
 		 246 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  71.31 
 
 		 246 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  71.31 
 
 		 246 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  71.31 
 
 		 246 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  70.46 
 
 		 246 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  70.46 
 
 		 246 aa  351  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  71.73 
 
 		 243 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 243 aa  351  7e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 243 aa  351  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 243 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 243 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 243 aa  351  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 243 aa  351  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 243 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  70.89 
 
 		 238 aa  349  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  74.58 
 
 		 243 aa  348  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  71.06 
 
 		 246 aa  347  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  69.79 
 
 		 246 aa  346  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  70.46 
 
 		 243 aa  342  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  69.49 
 
 		 238 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  68.22 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  69.2 
 
 		 238 aa  341  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  69.36 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  70.04 
 
 		 241 aa  339  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  68.51 
 
 		 246 aa  339  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  68.64 
 
 		 238 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  69.79 
 
 		 241 aa  338  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  66.81 
 
 		 238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  69.07 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  68.09 
 
 		 244 aa  332  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 239 aa  331  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 238 aa  328  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  68.51 
 
 		 241 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  67.8 
 
 		 243 aa  327  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  67.09 
 
 		 243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 239 aa  325  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  67.23 
 
 		 244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  66.81 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  65.68 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 242 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  67.09 
 
 		 253 aa  322  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  63.03 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  66.11 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  67.51 
 
 		 238 aa  318  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  318  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  319  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 238 aa  319  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  67.51 
 
 		 238 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  67.51 
 
 		 238 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  67.51 
 
 		 238 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  67.51 
 
 		 238 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  67.09 
 
 		 238 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  67.09 
 
 		 238 aa  318  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  67.09 
 
 		 238 aa  318  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 237 aa  318  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 241 aa  318  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0254  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 238 aa  318  7e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  66.96 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  64.29 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 243 aa  316  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 241 aa  315  5e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 241 aa  315  5e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 238 aa  314  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 238 aa  314  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 238 aa  314  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 238 aa  314  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 238 aa  314  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 238 aa  314  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  66.52 
 
 		 242 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  66.52 
 
 		 242 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 238 aa  312  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 237 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 241 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 237 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 237 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2882  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 237 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  65.68 
 
 		 238 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 237 aa  310  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  67.39 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 239 aa  309  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 239 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 239 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2658  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.624871  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  62.34 
 
 		 239 aa  308  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 239 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 237 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>