112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3780 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 63 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  74.6 
 
 		 63 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.43 
 
 		 63 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.43 
 
 		 63 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  69.84 
 
 		 63 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  69.84 
 
 		 63 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 		 63 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 		 63 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.73 
 
 		 63 aa  84.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  49.21 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  53.97 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  47.62 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  52.54 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.69 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  47.62 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  52.73 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.68 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 62 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 62 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.84 
 
 		 77 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  36.36 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  42.37 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0086  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  48.28 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.26 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  35.94 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.66 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>