More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3778 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  75.45 
 
 		 799 aa  1229    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  100 
 
 		 796 aa  1619    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  32.01 
 
 		 797 aa  429  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  31.11 
 
 		 791 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  33.24 
 
 		 792 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  31.7 
 
 		 790 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  30.85 
 
 		 808 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  30.97 
 
 		 830 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  28.45 
 
 		 806 aa  352  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  28.2 
 
 		 805 aa  347  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  29.11 
 
 		 805 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  29.11 
 
 		 805 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  29.37 
 
 		 771 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  29.37 
 
 		 771 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  29.25 
 
 		 771 aa  287  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  27.83 
 
 		 772 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  28.35 
 
 		 768 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  28.86 
 
 		 771 aa  281  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  28.57 
 
 		 772 aa  281  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  28.02 
 
 		 769 aa  280  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  29.61 
 
 		 820 aa  278  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  27.11 
 
 		 784 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  28.55 
 
 		 771 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  28.55 
 
 		 771 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  28.55 
 
 		 771 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  28.43 
 
 		 771 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  27.87 
 
 		 768 aa  272  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  28.99 
 
 		 771 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  26.57 
 
 		 787 aa  266  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  28.16 
 
 		 767 aa  266  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  27.78 
 
 		 771 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  28.55 
 
 		 767 aa  258  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  28.75 
 
 		 804 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  28.08 
 
 		 770 aa  256  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  28.08 
 
 		 794 aa  255  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  27.6 
 
 		 786 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  26.55 
 
 		 834 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  27.21 
 
 		 786 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  27.21 
 
 		 786 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  26.92 
 
 		 786 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  26.48 
 
 		 797 aa  245  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  26.74 
 
 		 786 aa  243  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  27.53 
 
 		 816 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  27.35 
 
 		 799 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  27.65 
 
 		 786 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  26.36 
 
 		 786 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  27.63 
 
 		 804 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  28.04 
 
 		 783 aa  241  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  26.9 
 
 		 786 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  26.9 
 
 		 786 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  28.31 
 
 		 810 aa  240  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  26.62 
 
 		 808 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  25.46 
 
 		 799 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  25.06 
 
 		 796 aa  235  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  26.4 
 
 		 831 aa  235  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  25.19 
 
 		 799 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  25.68 
 
 		 790 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  25.35 
 
 		 799 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  25.63 
 
 		 796 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  25.25 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  26.55 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  26 
 
 		 793 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  26.23 
 
 		 795 aa  232  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  27.04 
 
 		 821 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  25.03 
 
 		 794 aa  227  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  24.74 
 
 		 784 aa  223  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  26.45 
 
 		 821 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  25.22 
 
 		 813 aa  218  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  24.21 
 
 		 1051 aa  216  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  26.35 
 
 		 827 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  26.36 
 
 		 813 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  24.8 
 
 		 826 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  26.23 
 
 		 813 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  22.88 
 
 		 787 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25 
 
 		 764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  26.13 
 
 		 809 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  26.25 
 
 		 808 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1083 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.69 
 
 		 755 aa  134  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.19 
 
 		 806 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.95 
 
 		 808 aa  118  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.19 
 
 		 778 aa  117  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  29.49 
 
 		 898 aa  114  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.66 
 
 		 831 aa  114  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.56 
 
 		 788 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.43 
 
 		 905 aa  105  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.18 
 
 		 811 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  19.53 
 
 		 779 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.44 
 
 		 773 aa  97.4  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.73 
 
 		 807 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  19.89 
 
 		 764 aa  97.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.76 
 
 		 779 aa  94.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.09 
 
 		 803 aa  94.4  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  19.44 
 
 		 792 aa  88.2  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  19.48 
 
 		 789 aa  88.2  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.14 
 
 		 800 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.91 
 
 		 861 aa  81.6  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.84 
 
 		 727 aa  80.5  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  22.69 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.58 
 
 		 804 aa  78.2  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>