More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3727 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 572 aa  1148    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  42.91 
 
 		 573 aa  422  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  37.41 
 
 		 562 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  42.97 
 
 		 592 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.4 
 
 		 571 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 613 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  34.44 
 
 		 613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 613 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  33.15 
 
 		 635 aa  279  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 616 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 607 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  35.14 
 
 		 607 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 607 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  33.77 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  33.77 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  33.77 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  33.77 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  33.77 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  33.77 
 
 		 606 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 607 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 		 586 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.39 
 
 		 645 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  33.21 
 
 		 645 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  33.46 
 
 		 642 aa  258  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  34.24 
 
 		 616 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.45 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  32.8 
 
 		 625 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  32.09 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 584 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  31.48 
 
 		 595 aa  230  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  31.82 
 
 		 620 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 574 aa  227  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  31.44 
 
 		 584 aa  226  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  33.58 
 
 		 594 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 599 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 595 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 573 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  30.39 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.12 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  30.2 
 
 		 575 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  30.57 
 
 		 591 aa  211  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 556 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.52 
 
 		 582 aa  210  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  30.42 
 
 		 575 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  32.13 
 
 		 609 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  28.85 
 
 		 603 aa  207  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 553 aa  207  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 585 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 573 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  30.27 
 
 		 573 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 573 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 575 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  30.39 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 		 574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 594 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  37.12 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  45.4 
 
 		 494 aa  150  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.2 
 
 		 564 aa  146  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 606 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  30.38 
 
 		 619 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  41.1 
 
 		 495 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  35.02 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 603 aa  123  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  27.05 
 
 		 621 aa  117  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 562 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.16 
 
 		 572 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 621 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  26.83 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 568 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.39 
 
 		 557 aa  114  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  27.92 
 
 		 592 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 592 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 		 572 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 		 563 aa  113  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 594 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.48 
 
 		 573 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.9 
 
 		 573 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 		 595 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 599 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 617 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  23.61 
 
 		 632 aa  108  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  29.92 
 
 		 593 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  37.71 
 
 		 572 aa  107  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  29.23 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  27.18 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>