More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3706 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  634    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  57.74 
 
 		 316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  54.64 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  48.72 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  47.59 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  41.16 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  42.09 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  38.59 
 
 		 321 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  38.17 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  38.68 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  40 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  38.98 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  38.26 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  38.61 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  37.89 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  37.89 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  38.75 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  37.97 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.44 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  37.66 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  37.85 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  35.16 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  37.03 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  36.71 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.11 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  37.54 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  36.71 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.54 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  35.13 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  33.75 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  36.68 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  57.03 
 
 		 153 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  52.55 
 
 		 149 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  54.69 
 
 		 149 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 		 142 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  39.46 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  54.96 
 
 		 149 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 147 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  31.83 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  54.2 
 
 		 149 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  53.49 
 
 		 137 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  54.2 
 
 		 149 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 		 147 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  54.2 
 
 		 149 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 		 147 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  54.2 
 
 		 149 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 		 147 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  53.44 
 
 		 149 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 147 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  53.44 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  53.44 
 
 		 149 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  51.18 
 
 		 151 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 147 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  31.04 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 		 150 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  52.67 
 
 		 142 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  52.67 
 
 		 141 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  52.99 
 
 		 153 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 		 159 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  52.99 
 
 		 152 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 		 166 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  52.99 
 
 		 152 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  32.06 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 172 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  35.45 
 
 		 212 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  49.25 
 
 		 166 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 		 151 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.92 
 
 		 199 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 138 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 		 155 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 148 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 148 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 137 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  38.54 
 
 		 196 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  36.32 
 
 		 194 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  38.92 
 
 		 194 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  36.32 
 
 		 194 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 138 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.95 
 
 		 196 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  37.88 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  38.95 
 
 		 196 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  37.88 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  37.88 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  38.92 
 
 		 194 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 		 218 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  38.92 
 
 		 194 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  37.88 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  38.92 
 
 		 194 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 169 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  37.88 
 
 		 209 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.7 
 
 		 144 aa  92.8  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  44.7 
 
 		 132 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 138 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.68 
 
 		 220 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  44.7 
 
 		 134 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 138 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.65 
 
 		 213 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  44.36 
 
 		 137 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  44.36 
 
 		 142 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 132 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>