282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3683 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
106 aa  222  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  70.87 
 
 
103 aa  158  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  70.71 
 
 
103 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  71.72 
 
 
102 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  71.72 
 
 
102 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  71.72 
 
 
102 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  71.72 
 
 
102 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  71.72 
 
 
102 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  71.72 
 
 
102 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  71.72 
 
 
102 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  70.71 
 
 
102 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  69.61 
 
 
117 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  71 
 
 
109 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  69.7 
 
 
103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  69.7 
 
 
103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  67.65 
 
 
103 aa  153  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  68 
 
 
105 aa  153  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  69.31 
 
 
110 aa  152  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 
108 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  71.13 
 
 
109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  67.68 
 
 
103 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  67.68 
 
 
103 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  67.68 
 
 
103 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 
103 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  67.68 
 
 
103 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  67.33 
 
 
103 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  65.05 
 
 
107 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  66.02 
 
 
109 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  66.02 
 
 
109 aa  148  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  69.39 
 
 
109 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  66.34 
 
 
103 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  64.65 
 
 
103 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  65.35 
 
 
103 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  65.66 
 
 
103 aa  146  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  64.36 
 
 
102 aa  146  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  65.71 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  63.11 
 
 
105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  61.54 
 
 
106 aa  143  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  62.38 
 
 
102 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  58.49 
 
 
110 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  58.49 
 
 
110 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  63.55 
 
 
111 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  64.58 
 
 
106 aa  139  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  64.71 
 
 
111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0701  glutaredoxin-like protein  60 
 
 
110 aa  137  3e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  61.76 
 
 
120 aa  136  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 
111 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  60.75 
 
 
111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  59 
 
 
110 aa  134  5e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  60.2 
 
 
99 aa  134  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  59.18 
 
 
99 aa  133  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0187  glutaredoxin-like protein  59.8 
 
 
111 aa  133  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381703  normal  0.468757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  58.16 
 
 
308 aa  133  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 
109 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1116  glutaredoxin-like protein  60.78 
 
 
120 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  56.19 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  63 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  57 
 
 
108 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  58.49 
 
 
110 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  62 
 
 
114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  60.78 
 
 
117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  61.22 
 
 
109 aa  130  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  57.01 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  60 
 
 
107 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  58.82 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  57.01 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1021  glutaredoxin-like protein  61.7 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681267  normal  0.445361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  57.84 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  59.18 
 
 
123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  56.19 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  56 
 
 
107 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  57.58 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_004310  BR0835  glutaredoxin-related protein  57.41 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  56.48 
 
 
111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  57 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0827  glutaredoxin-related protein  57.41 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  57 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  58.1 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  60.61 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2391  glutaredoxin-like protein  55.56 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0012  glutaredoxin-like protein  56.86 
 
 
111 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0491  glutaredoxin-related protein  56.86 
 
 
107 aa  124  5e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249105  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  55.45 
 
 
113 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  55.34 
 
 
113 aa  123  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3704  glutaredoxin-like protein  55.66 
 
 
127 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473777  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  54.37 
 
 
123 aa  123  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0014  glutaredoxin-like protein  55.88 
 
 
111 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.900956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0013  glutaredoxin-like protein  55.88 
 
 
111 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  56.73 
 
 
109 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  121  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  51.89 
 
 
115 aa  121  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  121  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  121  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  121  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  121  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  51.89 
 
 
115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>