33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3605 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  100 
 
 		 863 aa  1761    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  47.64 
 
 		 895 aa  811    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3159  hypothetical protein  33 
 
 		 900 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0980935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0666  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1193 aa  363  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1083  hypothetical protein  29.09 
 
 		 831 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0364  hypothetical protein  29.57 
 
 		 821 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5245  hypothetical protein  33.07 
 
 		 2204 aa  233  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291359  hitchhiker  0.0000299325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2554  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1131 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1677  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1131 aa  209  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3932  hypothetical protein  26.38 
 
 		 921 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0926169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2998  hypothetical protein  24.81 
 
 		 906 aa  187  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2457  hypothetical protein  29.64 
 
 		 866 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0520379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0671  hypothetical protein  27.48 
 
 		 831 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5244  hypothetical protein  45.74 
 
 		 175 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000191659  hitchhiker  0.000000566819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  33.68 
 
 		 109 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  29.59 
 
 		 110 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  31.46 
 
 		 110 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  33.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  48.9  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  33.71 
 
 		 110 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  35.23 
 
 		 110 aa  47.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  42.86 
 
 		 656 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  44.23 
 
 		 647 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  41.38 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  29.87 
 
 		 107 aa  44.3  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>