More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3597 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  41.88 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 
194 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.29 
 
 
658 aa  104  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  35.57 
 
 
198 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  35.33 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
196 aa  94.4  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  35.03 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  33.15 
 
 
207 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  31.05 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
409 aa  80.9  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
401 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.54 
 
 
607 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 
576 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
729 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 
264 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
373 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  34.29 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  31.43 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  38 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 
420 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.41 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  33.01 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 
417 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  33.66 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 
642 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  29.74 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  29.01 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  35.92 
 
 
641 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  28.87 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  28.87 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  31.73 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  31.07 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 
215 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  32.04 
 
 
225 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  30.16 
 
 
648 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  35.58 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  32.11 
 
 
340 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  33.98 
 
 
694 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  26.56 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.25 
 
 
172 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.05 
 
 
240 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  34.83 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  32.35 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  29.84 
 
 
367 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 
243 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  33.01 
 
 
652 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  35.51 
 
 
373 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 
652 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 
243 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  33.63 
 
 
514 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
464 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
221 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  34.95 
 
 
638 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  34.31 
 
 
221 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
221 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 
321 aa  61.2  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  34.95 
 
 
241 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 
240 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  30.1 
 
 
620 aa  61.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  37.37 
 
 
466 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 
240 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  36.63 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  32.35 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  31.73 
 
 
364 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  31.07 
 
 
890 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 
247 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  28.12 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  42.27 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  25.78 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  40.48 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 
376 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  31.07 
 
 
1026 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.71 
 
 
919 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 
248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 
220 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>