More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3581 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  792    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  77.16 
 
 
403 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  48.49 
 
 
415 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  48.7 
 
 
412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  48.48 
 
 
427 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  47.61 
 
 
421 aa  299  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  39.39 
 
 
417 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  41.81 
 
 
409 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
409 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  37.96 
 
 
404 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  37.97 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  36.73 
 
 
404 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  39.6 
 
 
403 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  38.88 
 
 
412 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  37.87 
 
 
405 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 
405 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  38.78 
 
 
407 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  37.85 
 
 
413 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  40.36 
 
 
528 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  39.95 
 
 
406 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  38.79 
 
 
425 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  38.05 
 
 
406 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  38.31 
 
 
417 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  38.79 
 
 
414 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  36.34 
 
 
404 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  37.44 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  40.3 
 
 
416 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 
405 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 
416 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  36.57 
 
 
410 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  40.05 
 
 
436 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
407 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  40.26 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  40.26 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  40.36 
 
 
398 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  40.26 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  40.26 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  40.26 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  40.26 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  40.31 
 
 
412 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  37.82 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  39.34 
 
 
402 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  37.91 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  40.45 
 
 
414 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  38.5 
 
 
402 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  37.4 
 
 
400 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  38.6 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  39.53 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  39.28 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  38.17 
 
 
410 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  37.91 
 
 
410 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  37.91 
 
 
410 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  36.52 
 
 
430 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  39.07 
 
 
410 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  36.79 
 
 
406 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  36.67 
 
 
412 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  34.62 
 
 
412 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  37.89 
 
 
410 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  37.92 
 
 
402 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  38.4 
 
 
410 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  33.33 
 
 
414 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  35.19 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  34.61 
 
 
412 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  34.61 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  36.56 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  37.08 
 
 
401 aa  219  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
408 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  33.67 
 
 
411 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  33.98 
 
 
433 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  33.66 
 
 
421 aa  216  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  31.57 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  35.09 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  33.5 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
408 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  35.16 
 
 
413 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  34.31 
 
 
411 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 
405 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  36.75 
 
 
410 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  31.35 
 
 
389 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  31.65 
 
 
411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  33.77 
 
 
422 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
405 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.8 
 
 
428 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
433 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
442 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
438 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  32.49 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  30.75 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  30.38 
 
 
431 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  32.12 
 
 
425 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.23 
 
 
442 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  28.29 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.9 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.9 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  28.42 
 
 
457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>