More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3523 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  92.39 
 
 		 187 aa  323  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  73.63 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  66.48 
 
 		 184 aa  253  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  66.48 
 
 		 186 aa  250  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  64.84 
 
 		 186 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  64.84 
 
 		 186 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  64.84 
 
 		 186 aa  247  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  64.84 
 
 		 186 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  64.84 
 
 		 186 aa  246  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  64.29 
 
 		 186 aa  244  6.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  65.38 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  65.38 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  64.29 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  64.29 
 
 		 186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  64.29 
 
 		 186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  64.29 
 
 		 186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  63.74 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  63.19 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  64.13 
 
 		 188 aa  238  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  62.09 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  62.64 
 
 		 188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  62.71 
 
 		 189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  62.5 
 
 		 192 aa  229  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  61.33 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  56.52 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  62.15 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  55.98 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  58.29 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  59.3 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  57.07 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  56.52 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  54.1 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  67.48 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  44.63 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  44.94 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  40 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  40 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.46 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  43.02 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  40.11 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  41.44 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  40.33 
 
 		 190 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  40.11 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  40 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  42.54 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  46.03 
 
 		 137 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  42.13 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 196 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  37.85 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.85 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.55 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  40.21 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  40.21 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.78 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.2 
 
 		 218 aa  111  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.16 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  40.41 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  38.42 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  39.89 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.85 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  40.64 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  40.32 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.1 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  41.15 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  40.84 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  40.84 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  40.84 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.11 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 313 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40.59 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  36.36 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>