More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3463 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  789    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  66.67 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  56.42 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  56.64 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  39.01 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  36.84 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  37.59 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  36.52 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  36.02 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  34.7 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  34.46 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  34.78 
 
 		 405 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  35.04 
 
 		 406 aa  227  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  35.71 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  34.31 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  35.28 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  34.31 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  36.92 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  34.21 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  34.78 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  38.04 
 
 		 411 aa  215  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  35.05 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  35.05 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  34.4 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  33.9 
 
 		 405 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  37.65 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  37.47 
 
 		 654 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  35.73 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  35.22 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  35.22 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  35.78 
 
 		 656 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  36.03 
 
 		 667 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  35.81 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  34.08 
 
 		 647 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  36.27 
 
 		 667 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  35.78 
 
 		 682 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  36.34 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  35.78 
 
 		 682 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  33.25 
 
 		 400 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  34.27 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  34.92 
 
 		 663 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  36.54 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  36.45 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  33.67 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  35.23 
 
 		 657 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  39.02 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  35.25 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.05 
 
 		 656 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  38.78 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  32.69 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  34.92 
 
 		 663 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  31.03 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  34.37 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  32.5 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  32.51 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  32.03 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  31.68 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.51 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  38.54 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  34.16 
 
 		 668 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  34.16 
 
 		 668 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 		 654 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  32.68 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  35.32 
 
 		 656 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  35.01 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  34.37 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  33.85 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  34.29 
 
 		 657 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.76 
 
 		 648 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.76 
 
 		 648 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  32.68 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  32.68 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  32.05 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  33.16 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  35.42 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  35.99 
 
 		 656 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  34.95 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  32.19 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  33.58 
 
 		 653 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  34.11 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  34.11 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  32.37 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  35.5 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  33.66 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  33.16 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  31.84 
 
 		 647 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  35.16 
 
 		 654 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  35.98 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>