More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3356 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  54.41 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  54.35 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  53.62 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  43.15 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  42.45 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  43.48 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  42.75 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  41.01 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  40.4 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  40.29 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  45.9 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  35.07 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  41.61 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  46.15 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  38.73 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  63.79 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  36.99 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  73.58 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  57.38 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.54 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  38.89 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  39.39 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  39.86 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  64.29 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  51.85 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.34 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.02 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  39.86 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  39.29 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  61.67 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  37.68 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  38.51 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  66.07 
 
 		 169 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  66.67 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  76.74 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  51.47 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  60.71 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  59.26 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  39.71 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  38.28 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  68 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  38.46 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  46.1 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.14 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  47.67 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0252  fimbrial protein pilin  36.69 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  47.5 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  86.11 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  58.33 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  56.36 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  37.82 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  56.9 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  63.27 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  40.96 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.83 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  54.1 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  44.32 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  39.84 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  47.83 
 
 		 199 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  43.06 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  52.73 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  70.45 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  52.73 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  35.92 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  52.73 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  69.57 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  52.73 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  52.73 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  50.88 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  54.1 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  52.73 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.22 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  88.57 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  40.32 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  60.78 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  50.91 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  34.87 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  45.83 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.57 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.78 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  46.05 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  38.89 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  54.55 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  60 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  38.71 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  42.36 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  63.27 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  45.45 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  79.41 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  38.62 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  33.78 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  79.41 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.94 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  39.44 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  42.5 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  41.89 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  42.67 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  50.91 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>