More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3347 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  100 
 
 
352 aa  719  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  35.44 
 
 
350 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  35.44 
 
 
350 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  38.75 
 
 
357 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  33.24 
 
 
355 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  36.34 
 
 
332 aa  201  2e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  35.14 
 
 
350 aa  196  5e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  35.35 
 
 
355 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  34.98 
 
 
347 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  35.14 
 
 
354 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  35.58 
 
 
330 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
351 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  34.47 
 
 
346 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  34.69 
 
 
371 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  36.45 
 
 
338 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  33.53 
 
 
351 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  34.06 
 
 
330 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.71 
 
 
346 aa  184  2e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.75 
 
 
330 aa  183  4e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  33.43 
 
 
337 aa  183  5e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  30.24 
 
 
350 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  33.44 
 
 
334 aa  180  3e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  33.44 
 
 
330 aa  180  3e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.12 
 
 
334 aa  179  5e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 
330 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.13 
 
 
337 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  32.8 
 
 
356 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  32.8 
 
 
356 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  33.99 
 
 
332 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 
332 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  33.88 
 
 
331 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 
333 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  33.44 
 
 
362 aa  166  6e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.61 
 
 
350 aa  165  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  32.29 
 
 
350 aa  163  4e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  31.12 
 
 
336 aa  163  5e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30 
 
 
335 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  30.49 
 
 
341 aa  160  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 
325 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  30.53 
 
 
335 aa  154  3e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  31.89 
 
 
351 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  31.89 
 
 
351 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  34.86 
 
 
351 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  31.89 
 
 
351 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  32.27 
 
 
351 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  30.7 
 
 
347 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  32.23 
 
 
352 aa  147  4e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  35.63 
 
 
345 aa  146  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  35.06 
 
 
341 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  30.77 
 
 
352 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28.14 
 
 
509 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  28.02 
 
 
384 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  27.02 
 
 
346 aa  137  3e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.99 
 
 
335 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  30.37 
 
 
346 aa  135  1e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.55 
 
 
335 aa  135  1e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  30.37 
 
 
346 aa  134  2e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.39 
 
 
359 aa  134  2e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 
335 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 
368 aa  132  8e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  29.04 
 
 
341 aa  128  2e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.97 
 
 
395 aa  125  8e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  31.73 
 
 
388 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 
346 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.02 
 
 
337 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  30.18 
 
 
366 aa  122  1e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  29.62 
 
 
339 aa  118  2e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25.39 
 
 
324 aa  117  2e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  28.46 
 
 
393 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.92 
 
 
395 aa  114  2e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.72 
 
 
531 aa  113  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  30.74 
 
 
399 aa  110  4e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.08 
 
 
378 aa  106  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  26.06 
 
 
376 aa  102  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  30.45 
 
 
563 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 
359 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  27.05 
 
 
355 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  24.38 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 
350 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  25.09 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  25.09 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  25.09 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  29.88 
 
 
420 aa  95.9  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  29.88 
 
 
420 aa  95.9  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  27.01 
 
 
368 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  24.37 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  26.72 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  25.44 
 
 
661 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  35.97 
 
 
146 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  23.56 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 
661 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  28 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  28.1 
 
 
416 aa  92.8  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.95 
 
 
386 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  24.1 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  26.4 
 
 
356 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 
546 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>