More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3345 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  100 
 
 
417 aa  822  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  50.27 
 
 
428 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  41.13 
 
 
434 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  42 
 
 
432 aa  275  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  41.16 
 
 
434 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  35.36 
 
 
432 aa  235  1e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  33.94 
 
 
434 aa  219  9e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
441 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  33.1 
 
 
445 aa  217  3e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  33.51 
 
 
434 aa  217  3e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
421 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  31.1 
 
 
443 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  30.86 
 
 
443 aa  201  2e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  31.23 
 
 
432 aa  197  2e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  30.99 
 
 
432 aa  196  5e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  30.92 
 
 
427 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  31.27 
 
 
430 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  31.27 
 
 
430 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  32.76 
 
 
428 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
437 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  31.78 
 
 
426 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  30.68 
 
 
422 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  32.52 
 
 
428 aa  184  2e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.73012e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  28.71 
 
 
443 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  30.99 
 
 
426 aa  179  6e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  31.97 
 
 
437 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  29.51 
 
 
430 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
439 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.53779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  31.46 
 
 
437 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  29.51 
 
 
430 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  28.05 
 
 
428 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
421 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  30.45 
 
 
425 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  30.45 
 
 
425 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  27.8 
 
 
428 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  31.59 
 
 
414 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  29.27 
 
 
431 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  28.68 
 
 
431 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
446 aa  147  4e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.64401e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  28.61 
 
 
417 aa  147  4e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  27.25 
 
 
432 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.85 
 
 
439 aa  143  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
415 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
425 aa  140  5e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  26.78 
 
 
434 aa  139  8e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  29.03 
 
 
432 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  28.22 
 
 
423 aa  137  3e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
395 aa  136  7e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.13 
 
 
418 aa  136  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  28.22 
 
 
423 aa  135  2e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  31.17 
 
 
418 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  25.97 
 
 
446 aa  133  8e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  25.97 
 
 
446 aa  133  8e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
439 aa  130  4e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
411 aa  130  5e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  30.63 
 
 
366 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  30.63 
 
 
366 aa  129  1e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  31.15 
 
 
425 aa  128  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
446 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  26.61 
 
 
426 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.27 
 
 
418 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  27.82 
 
 
405 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  29.35 
 
 
418 aa  122  1e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
392 aa  121  2e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
423 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  28.38 
 
 
437 aa  120  4e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  26.92 
 
 
384 aa  120  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  30.93 
 
 
412 aa  119  1e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  29.72 
 
 
420 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  29.89 
 
 
447 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  24.51 
 
 
452 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  29.89 
 
 
430 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  28.71 
 
 
446 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  24.51 
 
 
452 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
447 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  31.28 
 
 
398 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
423 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
431 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  29.6 
 
 
407 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  24.88 
 
 
451 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  29.82 
 
 
427 aa  111  2e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  34.57 
 
 
407 aa  111  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  30.53 
 
 
461 aa  112  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  26.03 
 
 
406 aa  111  2e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  25.59 
 
 
410 aa  111  2e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  24.29 
 
 
442 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
448 aa  110  4e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.29465e-11 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.35 
 
 
410 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  29.12 
 
 
420 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  29.68 
 
 
413 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  25.35 
 
 
429 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  27.27 
 
 
441 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  25.92 
 
 
442 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.51 
 
 
420 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  23.08 
 
 
427 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
486 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1823  major facilitator transporter  28.69 
 
 
396 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.262601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  28.11 
 
 
426 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  28.11 
 
 
426 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>