More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3327 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  100 
 
 		 206 aa  426  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  44.2 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  44.2 
 
 		 218 aa  177  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  43.81 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  40.2 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2894  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.55 
 
 		 318 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  33.52 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  32.37 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  34.2 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.79 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.6 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.79 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.84 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  28.7 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  40.35 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  35.5 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  30.6 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  33.85 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  32.12 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  34.46 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 217 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  33.33 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.93 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  32.82 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  32.82 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  32.82 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 265 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 265 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  34.43 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  32.82 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.22 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  35.03 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  32.82 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  32.82 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  32.82 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  35.5 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  31.25 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  33.73 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  34.3 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  34.3 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  31.75 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  35.47 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  35.47 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  32.04 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  31.25 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  33.53 
 
 		 196 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  33.53 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 217 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  32.54 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  32.82 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  34.29 
 
 		 545 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  34.1 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  32.76 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  35.47 
 
 		 203 aa  91.7  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  31.55 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  33.85 
 
 		 227 aa  91.3  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  33.73 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  32.02 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  32.73 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  31.09 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  31.55 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  32.95 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1569  cytochrome c, class I  29.65 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0100945  normal  0.526038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  29.61 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  28.86 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  29.35 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  30.86 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  30.57 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  29.38 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  30.66 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  30.66 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  32.24 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  33.53 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  33.53 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  31.44 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  30.7 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 255 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  34.81 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  35.22 
 
 		 292 aa  84.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>