20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3326 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  38.74 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  37.77 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  32.75 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  32.89 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  32.89 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  29.13 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  30.63 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  28.39 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  30.38 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  24.79 
 
 		 495 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 		 492 aa  82  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.42 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.5 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  24.56 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  25 
 
 		 433 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.93 
 
 		 531 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1579  hypothetical protein  25.29 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.287753  normal  0.662374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>