More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3265 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  71.81 
 
 
856 aa  1209  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  67.25 
 
 
861 aa  1157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  71.11 
 
 
855 aa  1167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  70.25 
 
 
856 aa  1222  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  100 
 
 
857 aa  1734  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  63.58 
 
 
856 aa  1085  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  68.15 
 
 
858 aa  1188  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  69.66 
 
 
855 aa  1144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  68.4 
 
 
872 aa  1103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  64.69 
 
 
890 aa  1089  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  53.02 
 
 
896 aa  874  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  47.01 
 
 
871 aa  716  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  68.73 
 
 
855 aa  1163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  68.38 
 
 
862 aa  1118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  66.74 
 
 
861 aa  1134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  67.25 
 
 
861 aa  1157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  67.79 
 
 
865 aa  1154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.42292e-09 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  66.9 
 
 
875 aa  1160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  71.11 
 
 
855 aa  1167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  66.08 
 
 
856 aa  1132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  38.77 
 
 
876 aa  605  1e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  41.44 
 
 
878 aa  598  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  37.88 
 
 
894 aa  595  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  42.71 
 
 
894 aa  597  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  41.14 
 
 
906 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  42.34 
 
 
914 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  40.48 
 
 
886 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  40.48 
 
 
886 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  40.21 
 
 
902 aa  582  1e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  39.47 
 
 
885 aa  582  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  40.49 
 
 
883 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  38.12 
 
 
882 aa  575  1e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  40.48 
 
 
877 aa  573  1e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  40.38 
 
 
910 aa  573  1e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  40.48 
 
 
877 aa  572  1e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  37.94 
 
 
887 aa  575  1e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  39.61 
 
 
895 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  37.62 
 
 
893 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  41.78 
 
 
879 aa  561  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40.23 
 
 
918 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  40.11 
 
 
908 aa  554  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  39.66 
 
 
881 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  40.07 
 
 
879 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  39.54 
 
 
901 aa  541  1e-152  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  38.35 
 
 
900 aa  522  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  40.44 
 
 
939 aa  518  1e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  34.66 
 
 
874 aa  508  1e-142  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  41.79 
 
 
746 aa  508  1e-142  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.42 
 
 
874 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  40.33 
 
 
751 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  39.47 
 
 
722 aa  460  1e-128  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  37.64 
 
 
730 aa  458  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  40.27 
 
 
755 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  37.79 
 
 
727 aa  452  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.02251e-09 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  37.38 
 
 
741 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  38.72 
 
 
743 aa  449  1e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  40.38 
 
 
748 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  38.04 
 
 
744 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  37.94 
 
 
723 aa  432  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  37.7 
 
 
723 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  37.63 
 
 
727 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  37.46 
 
 
730 aa  419  1e-115  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.69 
 
 
637 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  32.16 
 
 
622 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  31.4 
 
 
646 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  29.97 
 
 
560 aa  203  1e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  33.07 
 
 
584 aa  202  2e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.87 
 
 
778 aa  201  4e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.87 
 
 
778 aa  201  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  29.69 
 
 
636 aa  197  5e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.18 
 
 
573 aa  196  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  35.36 
 
 
538 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  38.11 
 
 
576 aa  194  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  34.73 
 
 
664 aa  191  6e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  34.67 
 
 
328 aa  185  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.41 
 
 
755 aa  175  4e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.51 
 
 
757 aa  174  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.15 
 
 
755 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  20.83 
 
 
741 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.48446e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.49 
 
 
647 aa  172  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  34.59 
 
 
585 aa  166  1e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.91 
 
 
569 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  34.38 
 
 
597 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  33.43 
 
 
593 aa  160  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
593 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  35.33 
 
 
581 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  34.72 
 
 
571 aa  157  5e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.74 
 
 
584 aa  157  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  33.43 
 
 
579 aa  157  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  34.59 
 
 
585 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.07 
 
 
725 aa  154  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 
562 aa  153  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  33.83 
 
 
581 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 
594 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.67 
 
 
1086 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  33.83 
 
 
581 aa  153  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 
594 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 
594 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  33.83 
 
 
581 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
588 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>