More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3220 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  47.62 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  48.19 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  44.78 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  49.42 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  44.04 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  45.6 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.42 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  44.06 
 
 		 279 aa  141  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  43.3 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  43.08 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  43.08 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  43.92 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  42.56 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  42.35 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  43.88 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  42.08 
 
 		 295 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  43.85 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  41.47 
 
 		 292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  41.01 
 
 		 300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  41.55 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  41.28 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  57.89 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  43.26 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  43.39 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.75 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  40.69 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  38.07 
 
 		 290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  37.1 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  43.15 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  52.31 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  43.23 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 215 aa  124  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  56.78 
 
 		 278 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  49.63 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  55.93 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  41.14 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  47.1 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  34.93 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  53.72 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  40 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 296 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  48.51 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  39.06 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  44.69 
 
 		 296 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  44.69 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  50.83 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  41.57 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  49.58 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41.21 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  37.91 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  40.35 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  38.74 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.56 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  39.78 
 
 		 299 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 		 280 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  38.34 
 
 		 326 aa  111  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  42.63 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  42.47 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  54.31 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  42.47 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  40.11 
 
 		 304 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.49 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  49.57 
 
 		 328 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.31 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  33.64 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  44.53 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  37.57 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  52.14 
 
 		 146 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  50.88 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  49.12 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  47.59 
 
 		 438 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  49.22 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.45 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  37.16 
 
 		 329 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  45.54 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  45.52 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  51.24 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 239 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  47.76 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50.46 
 
 		 442 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  47.54 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>