More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3217 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  100 
 
 		 159 aa  318  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  64.47 
 
 		 168 aa  190  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  64.29 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  60.78 
 
 		 161 aa  187  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  61.44 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  57.32 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  55.97 
 
 		 172 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  55.13 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  54.04 
 
 		 176 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  53.85 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  51.27 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  51.3 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  54.61 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  50.62 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  43.4 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  49.38 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  50 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  47.44 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  48.72 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  43.04 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  45.57 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  41.32 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  44.38 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  45.91 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 140 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  43.9 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42.68 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  36.88 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  42.5 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  40.85 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  37.82 
 
 		 137 aa  84.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  38.99 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  35.09 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  33.12 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  34.19 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  32.28 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  33.13 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  32.89 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.77 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.92 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  32.03 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  28.85 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  31.82 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  33.97 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  33.12 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  28.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  32.89 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  29.75 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  30.13 
 
 		 124 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  54.17 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  31.54 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.82 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  33.12 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  30.72 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  35.09 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  29.49 
 
 		 124 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  27.92 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  27.63 
 
 		 133 aa  50.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  29.03 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  34.53 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  30.47 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  26.35 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  26.35 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  26.35 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  44.83 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  41.51 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  41.51 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  38.89 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  25.81 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  40.32 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  37.76 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  28.03 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  40.38 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  33.04 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  35.78 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  30.83 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  38.98 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  40.98 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  38.6 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  32.12 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  28.1 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  28.1 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.51 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  27.27 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  26.85 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  29.19 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  40.68 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  33.78 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  29.09 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>